27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3156 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3156  general secretion pathway protein B  100 
 
 
372 aa  752    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.997514  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1234  general secretion pathway protein B  97.31 
 
 
372 aa  728    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0914005  normal  0.846255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1201  general secretion pathway protein B  96.51 
 
 
372 aa  719    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1157  general secretion pathway protein B  97.85 
 
 
372 aa  731    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1117  general secretion pathway protein B  55.93 
 
 
355 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3074  general secretion pathway protein B  57.99 
 
 
366 aa  388  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212053  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298  general secretion pathway protein B  56.04 
 
 
368 aa  388  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2977  general secretion pathway protein B  55.87 
 
 
371 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.391436  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2895  general secretion pathway protein B  53.5 
 
 
377 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2982  general secretion pathway protein B  43.98 
 
 
369 aa  262  6e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0973  general secretion pathway protein B  44.73 
 
 
358 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.637256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1086  general secretion pathway protein B  40.31 
 
 
339 aa  240  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.970223  hitchhiker  0.0086707 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2821  general secretion pathway protein B  37.67 
 
 
420 aa  233  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000107284  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1010  general secretion pathway protein B  41.58 
 
 
375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00086545  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1168  general secretion pathway protein B  39.14 
 
 
328 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000621685  hitchhiker  0.00000787826 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0836  general secretion pathway protein B  39.24 
 
 
370 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.19872  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03090  General secretion pathway protein B  28.78 
 
 
415 aa  72.4  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3280  hypothetical protein  38.27 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.539633  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00860  Type II secretory pathway, component ExeA  32.26 
 
 
240 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001612  general secretion pathway protein B  31.25 
 
 
227 aa  60.1  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.33696  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2022  putative general secretion pathway protein B  35.94 
 
 
256 aa  57  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000127173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  37.14 
 
 
563 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2687  hypothetical protein  28.45 
 
 
233 aa  53.1  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.235292  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2980  hypothetical protein  34.72 
 
 
237 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0082  hypothetical protein  37.5 
 
 
247 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000224621  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0472  hypothetical protein  34.33 
 
 
269 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2821  hypothetical protein  33.78 
 
 
229 aa  43.1  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.163509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>