25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1086 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1086  general secretion pathway protein B  100 
 
 		 339 aa  680    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.970223  hitchhiker  0.0086707 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1168  general secretion pathway protein B  57.55 
 
 		 328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000621685  hitchhiker  0.00000787826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0973  general secretion pathway protein B  48.24 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.637256  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1010  general secretion pathway protein B  44.39 
 
 		 375 aa  263  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00086545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1234  general secretion pathway protein B  40.77 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0914005  normal  0.846255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1201  general secretion pathway protein B  39.95 
 
 		 372 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3156  general secretion pathway protein B  40.31 
 
 		 372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.997514  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3074  general secretion pathway protein B  41.34 
 
 		 366 aa  239  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212053  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1157  general secretion pathway protein B  40.21 
 
 		 372 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1117  general secretion pathway protein B  42.9 
 
 		 355 aa  235  9e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2895  general secretion pathway protein B  39.9 
 
 		 377 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298  general secretion pathway protein B  40.15 
 
 		 368 aa  228  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2977  general secretion pathway protein B  40.26 
 
 		 371 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.391436  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2982  general secretion pathway protein B  38.95 
 
 		 369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2821  general secretion pathway protein B  36.41 
 
 		 420 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000107284  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0836  general secretion pathway protein B  39.02 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.19872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03090  General secretion pathway protein B  40.26 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3280  hypothetical protein  31.58 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.539633  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00860  Type II secretory pathway, component ExeA  33.87 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001612  general secretion pathway protein B  32.31 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.33696  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  28.93 
 
 		 563 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2022  putative general secretion pathway protein B  30 
 
 		 256 aa  54.3  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000127173  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2687  hypothetical protein  33.87 
 
 		 233 aa  52.8  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.235292  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0178  general secretion pathway protein B  26.09 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.953003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2980  hypothetical protein  34.72 
 
 		 237 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>