21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1297 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1297  general secretion pathway protein  100 
 
 		 209 aa  425  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1468  general secretion pathway protein  55.22 
 
 		 209 aa  207  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1409  general secretion pathway protein  44 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2864  general secretion pathway protein  42.55 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.839881  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2022  putative general secretion pathway protein B  36.76 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000127173  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03090  General secretion pathway protein B  40.3 
 
 		 415 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1586  hypothetical protein  29.36 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0472  hypothetical protein  37.29 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00860  Type II secretory pathway, component ExeA  32.35 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001612  general secretion pathway protein B  32.35 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.33696  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2498  general secretion pathway protein B  35.59 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3280  hypothetical protein  33.33 
 
 		 381 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.539633  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  40.62 
 
 		 563 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0178  general secretion pathway protein B  30 
 
 		 275 aa  45.4  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.953003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2687  hypothetical protein  25.44 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.235292  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2821  hypothetical protein  31.58 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.163509 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0836  general secretion pathway protein B  35.09 
 
 		 370 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.19872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0973  general secretion pathway protein B  33.33 
 
 		 358 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.637256  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2980  hypothetical protein  29.82 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1032  general secretion pathway protein B  31.48 
 
 		 252 aa  42  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0789  hypothetical protein  33.96 
 
 		 251 aa  41.6  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>