22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2864 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2864  general secretion pathway protein  100 
 
 		 190 aa  384  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.839881  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1409  general secretion pathway protein  80.95 
 
 		 187 aa  294  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1468  general secretion pathway protein  43.17 
 
 		 209 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1297  general secretion pathway protein  46.63 
 
 		 209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2022  putative general secretion pathway protein B  32.22 
 
 		 256 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000127173  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03090  General secretion pathway protein B  37.5 
 
 		 415 aa  52.8  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001612  general secretion pathway protein B  32.35 
 
 		 227 aa  51.2  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.33696  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00860  Type II secretory pathway, component ExeA  30.43 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3280  hypothetical protein  30.56 
 
 		 381 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.539633  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1147  hypothetical protein  29.91 
 
 		 271 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0178  general secretion pathway protein B  32.86 
 
 		 275 aa  47.8  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.953003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1586  hypothetical protein  30.56 
 
 		 252 aa  47.8  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0836  general secretion pathway protein B  31.88 
 
 		 370 aa  45.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.19872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2821  general secretion pathway protein B  31.88 
 
 		 420 aa  45.1  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000107284  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2498  general secretion pathway protein B  29.79 
 
 		 261 aa  44.7  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234384 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2982  general secretion pathway protein B  30.43 
 
 		 369 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0472  hypothetical protein  30.3 
 
 		 269 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1168  general secretion pathway protein B  32.91 
 
 		 328 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000621685  hitchhiker  0.00000787826 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1117  general secretion pathway protein B  33.33 
 
 		 355 aa  42.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  37.5 
 
 		 563 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0973  general secretion pathway protein B  33.33 
 
 		 358 aa  41.6  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.637256  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298  general secretion pathway protein B  30.43 
 
 		 368 aa  42  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>