12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2498 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2498  general secretion pathway protein B  100 
 
 		 261 aa  492  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234384 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1032  general secretion pathway protein B  53.66 
 
 		 252 aa  85.9  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2821  hypothetical protein  43.66 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.163509 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0472  hypothetical protein  39.24 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1586  hypothetical protein  26.79 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1468  general secretion pathway protein  32.33 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1297  general secretion pathway protein  29.66 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22870  hypothetical protein  36.11 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.327708  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0789  hypothetical protein  84 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2980  hypothetical protein  27.94 
 
 		 237 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0082  hypothetical protein  30.88 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000224621  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  32.54 
 
 		 840 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>