29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2980 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2980  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2821  hypothetical protein  52.11 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.163509 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0082  hypothetical protein  56.96 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000224621  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1032  general secretion pathway protein B  36.47 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0789  hypothetical protein  46.27 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22870  hypothetical protein  42.42 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.327708  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1586  hypothetical protein  27.6 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0836  general secretion pathway protein B  35.11 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.19872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1234  general secretion pathway protein B  34.83 
 
 		 372 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0914005  normal  0.846255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1157  general secretion pathway protein B  34.83 
 
 		 372 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3156  general secretion pathway protein B  34.83 
 
 		 372 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.997514  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1201  general secretion pathway protein B  34.83 
 
 		 372 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3074  general secretion pathway protein B  32.97 
 
 		 366 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212053  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2895  general secretion pathway protein B  32.97 
 
 		 377 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2977  general secretion pathway protein B  31.87 
 
 		 371 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.391436  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0060  general secretion pathway protein B, putative  33.33 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1117  general secretion pathway protein B  30.77 
 
 		 355 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298  general secretion pathway protein B  31.87 
 
 		 368 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1010  general secretion pathway protein B  31.87 
 
 		 375 aa  48.9  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00086545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1168  general secretion pathway protein B  34.72 
 
 		 328 aa  48.5  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000621685  hitchhiker  0.00000787826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1086  general secretion pathway protein B  32.97 
 
 		 339 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.970223  hitchhiker  0.0086707 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0973  general secretion pathway protein B  33.33 
 
 		 358 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.637256  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2498  general secretion pathway protein B  28.42 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234384 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1147  hypothetical protein  24.63 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2982  general secretion pathway protein B  30.61 
 
 		 369 aa  45.4  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1297  general secretion pathway protein  29.82 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3280  hypothetical protein  25.93 
 
 		 381 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.539633  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1468  general secretion pathway protein  29.82 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0472  hypothetical protein  44.93 
 
 		 269 aa  42  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.14084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>