24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1010 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1010  general secretion pathway protein B  100 
 
 		 375 aa  742    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00086545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1086  general secretion pathway protein B  45.12 
 
 		 339 aa  276  6e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.970223  hitchhiker  0.0086707 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1168  general secretion pathway protein B  48.15 
 
 		 328 aa  260  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000621685  hitchhiker  0.00000787826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0973  general secretion pathway protein B  45.7 
 
 		 358 aa  256  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.637256  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1201  general secretion pathway protein B  41.94 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1157  general secretion pathway protein B  41.94 
 
 		 372 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1234  general secretion pathway protein B  41.44 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0914005  normal  0.846255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3156  general secretion pathway protein B  41.94 
 
 		 372 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.997514  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1117  general secretion pathway protein B  41.87 
 
 		 355 aa  242  7e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3074  general secretion pathway protein B  40.49 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212053  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298  general secretion pathway protein B  39.8 
 
 		 368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2895  general secretion pathway protein B  39.85 
 
 		 377 aa  233  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2977  general secretion pathway protein B  40.2 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.391436  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2821  general secretion pathway protein B  37.44 
 
 		 420 aa  216  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000107284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2982  general secretion pathway protein B  36.7 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0836  general secretion pathway protein B  35.7 
 
 		 370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.19872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3280  hypothetical protein  32.17 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.539633  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03090  General secretion pathway protein B  35.06 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001612  general secretion pathway protein B  34.38 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.33696  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00860  Type II secretory pathway, component ExeA  32.26 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2022  putative general secretion pathway protein B  32.26 
 
 		 256 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000127173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  34.29 
 
 		 563 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2687  hypothetical protein  32.26 
 
 		 233 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.235292  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2980  hypothetical protein  31.94 
 
 		 237 aa  43.9  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>