28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2982 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2982  general secretion pathway protein B  100 
 
 		 369 aa  746    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1201  general secretion pathway protein B  44.47 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1234  general secretion pathway protein B  43.68 
 
 		 372 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0914005  normal  0.846255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3156  general secretion pathway protein B  43.98 
 
 		 372 aa  262  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.997514  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1157  general secretion pathway protein B  43.16 
 
 		 372 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1117  general secretion pathway protein B  46.07 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1298  general secretion pathway protein B  42.97 
 
 		 368 aa  251  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2895  general secretion pathway protein B  42.2 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3074  general secretion pathway protein B  42.78 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212053  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2977  general secretion pathway protein B  42.4 
 
 		 371 aa  239  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.391436  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0973  general secretion pathway protein B  43.8 
 
 		 358 aa  233  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.637256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1086  general secretion pathway protein B  38.95 
 
 		 339 aa  219  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.970223  hitchhiker  0.0086707 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2821  general secretion pathway protein B  36.57 
 
 		 420 aa  210  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000107284  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1168  general secretion pathway protein B  37.28 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000621685  hitchhiker  0.00000787826 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0836  general secretion pathway protein B  37.08 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.19872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1010  general secretion pathway protein B  35.99 
 
 		 375 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00086545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00860  Type II secretory pathway, component ExeA  37.1 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001612  general secretion pathway protein B  35.94 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.33696  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03090  General secretion pathway protein B  33.33 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3280  hypothetical protein  27.19 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.539633  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2022  putative general secretion pathway protein B  34.38 
 
 		 256 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000127173  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2687  hypothetical protein  32.26 
 
 		 233 aa  54.7  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.235292  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  28.99 
 
 		 563 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2980  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1586  hypothetical protein  31.51 
 
 		 252 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2864  general secretion pathway protein  30.43 
 
 		 190 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.839881  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0472  hypothetical protein  33.82 
 
 		 269 aa  43.9  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1409  general secretion pathway protein  28.99 
 
 		 187 aa  43.5  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>