15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1032 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1032  general secretion pathway protein B  100 
 
 		 252 aa  473  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2498  general secretion pathway protein B  52.33 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234384 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2821  hypothetical protein  48 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.163509 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0472  hypothetical protein  42.11 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2980  hypothetical protein  36.62 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22870  hypothetical protein  40.85 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.327708  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0789  hypothetical protein  42.19 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1586  hypothetical protein  26.15 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0082  hypothetical protein  33.8 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000224621  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1147  hypothetical protein  23.32 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2821  general secretion pathway protein B  30 
 
 		 420 aa  48.9  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000107284  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1468  general secretion pathway protein  33.33 
 
 		 209 aa  45.4  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1297  general secretion pathway protein  31.48 
 
 		 209 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0973  general secretion pathway protein B  25.47 
 
 		 358 aa  42.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.637256  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  30.48 
 
 		 1028 aa  42.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>