More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1462 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 253 aa  511  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.72 
 
 		 262 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0450  enoyl-CoA hydratase  43.48 
 
 		 258 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  44.63 
 
 		 254 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4526  enoyl-CoA hydratase  43.92 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.27 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0389  enoyl-CoA hydratase  40.55 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593018 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0476  enoyl-CoA hydratase  43.43 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  43.03 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.67 
 
 		 245 aa  192  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0616524  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  42.63 
 
 		 254 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4035  enoyl-CoA hydratase  40.48 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.21 
 
 		 245 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2745  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.97 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0562194  normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6045  enoyl-CoA hydratase  43.95 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0684  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.86 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5771  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.58 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  43.08 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.53 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4029  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.64 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0664  enoyl-CoA hydratase  41.27 
 
 		 256 aa  178  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556097  normal  0.974332 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.53 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3262  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.19 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.97 
 
 		 245 aa  175  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.212368  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56250  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 		 257 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2745  enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0301258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2718  enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.189949  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0419  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02193  enoyl-CoA hydratase  35.42 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.114495  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3932  enoyl-CoA hydratase  40.25 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2106  enoyl-CoA hydratase  41.53 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1575  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.65 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_004310  BR0411  enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.477081  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.58 
 
 		 255 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3229  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.36 
 
 		 245 aa  170  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547446  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287025  decreased coverage  0.00358317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3630  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4199  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.66 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0335602  hitchhiker  0.000324097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4899  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.83 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.234346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3473  enoyl-CoA hydratase  40.25 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0427069  normal  0.591102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.56 
 
 		 279 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2485  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3240  enoyl-CoA hydratase  37.93 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596711  hitchhiker  0.0000100182 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2587  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000356951  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0764  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.22 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000610826 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3908  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.93 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1343  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0721  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000678732  hitchhiker  0.00168791 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0749  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.102863 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0577  enoyl-CoA hydratase  36.93 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0598  enoyl-CoA hydratase  36.93 
 
 		 258 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3582  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 		 245 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000838255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4449  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4083  enoyl-CoA hydratase  38.34 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 		 245 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000721466  hitchhiker  0.00000000959721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0809  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 		 245 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.044471  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0777  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 		 245 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0820  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2378  enoyl-CoA hydratase  40.33 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.0124738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.91 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.768102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0527  enoyl-CoA hydratase  36.14 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.850744  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1027  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.92 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0567  enoyl-CoA hydratase  40.55 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  34.4 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0698  enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0860  enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2745  enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0683  enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2413  enoyl-CoA hydratase  40.16 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0200  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.627685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2333  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2636  enoyl-CoA hydratase  42.57 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4754  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.97 
 
 		 242 aa  154  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1086  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2770  enoyl-CoA hydratase  42.17 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1748  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.828974  normal  0.0355231 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1056  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3512  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3732  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.25 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.407726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1899  enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 		 258 aa  150  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.55 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.593041  normal  0.157117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0488  enoyl-CoA hydratase  37.73 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2031  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0601  enoyl-CoA hydratase  37.95 
 
 		 251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.456666  normal  0.324394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.1 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0673  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.38 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0987  enoyl-CoA hydratase  37.95 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3325  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.08 
 
 		 250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2861  enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.742849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.08 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2174  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.08 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.262533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.7 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>