More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0318 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0318  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 270 aa  553  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2806  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.3 
 
 		 274 aa  278  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2264  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.94 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26690  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.94 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2693  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.9 
 
 		 265 aa  262  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.086276  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3949  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.92 
 
 		 265 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.10876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2816  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.96 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.23774  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 275 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.1 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1723  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 		 277 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0376622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0341  enoyl-CoA hydratase  31.44 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 		 265 aa  145  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0310  enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001541  methylglutaconyl-CoA hydratase  33.86 
 
 		 279 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 		 262 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.3 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3225  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80898  normal  0.0526792 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1601  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.02 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4192  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.8 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.415439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2927  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.1 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1346  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577541  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0223  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 		 265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1150  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.283717 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05478  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.45 
 
 		 281 aa  135  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  32 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 		 258 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4159  enoyl-CoA hydratase  31.15 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.965459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  30.89 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1456  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.08 
 
 		 279 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.735786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2729  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.68 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.16 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.346332 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  31.35 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1670  methylglutaconyl-CoA hydratase  30.26 
 
 		 286 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2324  methylglutaconyl-CoA hydratase  29.74 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2396  methylglutaconyl-CoA hydratase  29.74 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4688  enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.484689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2799  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.37 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3042  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.421055  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1895  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.12 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4721  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2031  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  32.31 
 
 		 266 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  0.397516 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1889  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 		 261 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2008  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1717  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.5 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0740  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4537  enoyl-CoA hydratase  29.88 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2572  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.74 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0113  enoyl-CoA hydratase  30.92 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0949  enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362092  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2511  enoyl-CoA hydratase  30.04 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.62 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1173  enoyl-CoA hydratase  30.04 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0016  enoyl-CoA hydratase  31.23 
 
 		 264 aa  129  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0013  enoyl-CoA hydratase  31.23 
 
 		 264 aa  129  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.76945  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.02 
 
 		 266 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2975  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.78 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.517707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3658  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  32.7 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.551488  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0962  enoyl-CoA hydratase  29.39 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663833 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3560  enoyl-CoA hydratase  29.39 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.68244  normal  0.681353 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3642  enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1528  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.63 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.837237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0041  enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568565  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0889  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.65979 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.23 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0750  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.610305  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2848  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.26 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.23 
 
 		 266 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4353  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 		 267 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2247  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.82 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.89 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6359  enoyl-CoA hydratase  31.7 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0245012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2830  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.41 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1360  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.5 
 
 		 276 aa  125  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.687458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1304  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 		 262 aa  126  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216289  normal  0.0904092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.86 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  31.75 
 
 		 263 aa  125  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1942  methylglutaconyl-CoA hydratase  32.68 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2546  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.27 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>