127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1873 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  84.15 
 
 
249 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  85.31 
 
 
247 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  83.47 
 
 
264 aa  436  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  82.11 
 
 
247 aa  434  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  80.08 
 
 
247 aa  422  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  78.05 
 
 
249 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  67.08 
 
 
419 aa  340  9e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  63.82 
 
 
432 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  58.75 
 
 
260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  55.69 
 
 
264 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0520  hypothetical protein  54.55 
 
 
262 aa  286  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  62.33 
 
 
234 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  52.51 
 
 
272 aa  286  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  62.33 
 
 
234 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6293  protein of unknown function DUF88  60 
 
 
262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  53.82 
 
 
272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11160  conserved hypothetical protein  53.67 
 
 
262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997063  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  55.83 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  51.84 
 
 
258 aa  273  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  52.26 
 
 
246 aa  272  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  52.71 
 
 
259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  48.8 
 
 
258 aa  263  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  50.59 
 
 
259 aa  262  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  50.72 
 
 
275 aa  262  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  51.18 
 
 
273 aa  261  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4745  hypothetical protein  50.8 
 
 
246 aa  258  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  50.82 
 
 
276 aa  251  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  48.21 
 
 
253 aa  249  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  48.82 
 
 
260 aa  246  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4482  hypothetical protein  48.96 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  48.64 
 
 
286 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4005  hypothetical protein  51.06 
 
 
263 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2026  hypothetical protein  48.79 
 
 
270 aa  223  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3025  protein of unknown function DUF88  43.17 
 
 
285 aa  222  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.775317  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  41.48 
 
 
268 aa  221  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  49.34 
 
 
335 aa  221  7e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  41.48 
 
 
268 aa  221  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  44.67 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  41.24 
 
 
284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3744  hypothetical protein  43.01 
 
 
287 aa  218  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  50 
 
 
249 aa  216  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1386  hypothetical protein  39.86 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  42.21 
 
 
242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1934  protein of unknown function DUF88  46.96 
 
 
552 aa  209  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000288494  normal  0.0274849 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0180  hypothetical protein  44.98 
 
 
254 aa  206  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  44.63 
 
 
239 aa  199  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0169  hypothetical protein  45.11 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.654892  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  44.87 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11150  hypothetical protein  43.44 
 
 
314 aa  192  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.280093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  43.4 
 
 
248 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  43.4 
 
 
248 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05410  Protein of unknown function DUF88  43.24 
 
 
312 aa  189  5e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000245308  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0057  hypothetical protein  42.92 
 
 
246 aa  188  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.184388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  42.4 
 
 
236 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  52.38 
 
 
371 aa  174  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4318  hypothetical protein  54.68 
 
 
298 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2536  hypothetical protein  39.17 
 
 
313 aa  157  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13473  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1180  hypothetical protein  32.17 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  36.11 
 
 
251 aa  132  6e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  31.92 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  32.86 
 
 
232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  31.92 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  29.36 
 
 
229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  32.03 
 
 
279 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  25.44 
 
 
334 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  29.07 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3462  hypothetical protein  39.55 
 
 
225 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  28.63 
 
 
253 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  28.63 
 
 
253 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  29.69 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  30.13 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  29.78 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0356  hypothetical protein  38.24 
 
 
160 aa  82  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198586 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  27.34 
 
 
496 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0857  protein of unknown function DUF88  35.71 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  29.51 
 
 
498 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  29.51 
 
 
498 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  29.51 
 
 
498 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  28.97 
 
 
501 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  29.22 
 
 
507 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  27.94 
 
 
421 aa  79.7  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  31.67 
 
 
472 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  31.67 
 
 
483 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  31.67 
 
 
483 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  31.67 
 
 
477 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  29.46 
 
 
508 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  33.12 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  27.02 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  28.81 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  35.83 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  25.81 
 
 
478 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  26.1 
 
 
480 aa  72  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2469  protein of unknown function DUF88  30.52 
 
 
629 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  27.94 
 
 
564 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  23.29 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5405  protein of unknown function DUF88  27.52 
 
 
450 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.964746  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  23.29 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  23.29 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  26.09 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>