127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0335 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0335  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  507  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000159017  normal  0.161063 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2085  hypothetical protein  84.62 
 
 
249 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000370224  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  81.71 
 
 
247 aa  431  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  80.08 
 
 
252 aa  422  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  79.27 
 
 
264 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  77.33 
 
 
249 aa  414  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  77.96 
 
 
247 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  67.22 
 
 
419 aa  341  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  65.57 
 
 
432 aa  335  5.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7469  protein of unknown function DUF88  60.08 
 
 
260 aa  318  5e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11160  conserved hypothetical protein  56.64 
 
 
262 aa  293  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997063  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  63.47 
 
 
234 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  63.47 
 
 
234 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  54.23 
 
 
272 aa  285  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  56 
 
 
264 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2871  hypothetical protein  56.84 
 
 
240 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6293  protein of unknown function DUF88  54.47 
 
 
262 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  53.88 
 
 
258 aa  276  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  54.83 
 
 
272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0520  hypothetical protein  52.49 
 
 
262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  51.44 
 
 
246 aa  261  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  50.39 
 
 
259 aa  261  8.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  52.02 
 
 
259 aa  260  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  51.59 
 
 
258 aa  259  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  48.75 
 
 
275 aa  257  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  50.58 
 
 
273 aa  256  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1025  hypothetical protein  47.67 
 
 
260 aa  244  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0102117  normal  0.260028 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03707  hypothetical protein  47.95 
 
 
276 aa  239  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2652  protein of unknown function DUF88  48.8 
 
 
253 aa  239  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000246678  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4745  hypothetical protein  49.57 
 
 
246 aa  235  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  47.88 
 
 
286 aa  231  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4482  hypothetical protein  45.64 
 
 
267 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2026  hypothetical protein  48.4 
 
 
270 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4005  hypothetical protein  48.09 
 
 
263 aa  223  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3025  protein of unknown function DUF88  43.32 
 
 
285 aa  222  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.775317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3744  hypothetical protein  44.79 
 
 
287 aa  219  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5232  hypothetical protein  41.61 
 
 
284 aa  217  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.682006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1386  hypothetical protein  39.73 
 
 
303 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4318  hypothetical protein  40.62 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.577985  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3564  hypothetical protein  41.67 
 
 
268 aa  211  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0656546 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3658  hypothetical protein  42.08 
 
 
242 aa  209  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0180  hypothetical protein  45.92 
 
 
254 aa  209  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  40.15 
 
 
268 aa  208  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1869  hypothetical protein  46.9 
 
 
335 aa  206  4e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.670416  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  42.92 
 
 
265 aa  205  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  44.81 
 
 
249 aa  202  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0048  hypothetical protein  44.9 
 
 
239 aa  201  7e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.665316  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1934  protein of unknown function DUF88  47.77 
 
 
552 aa  199  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000288494  normal  0.0274849 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0169  hypothetical protein  43.72 
 
 
271 aa  192  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.654892  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0057  hypothetical protein  42.44 
 
 
246 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.184388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1459  hypothetical protein  41.13 
 
 
248 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0110  hypothetical protein  41.13 
 
 
248 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.151004 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05410  Protein of unknown function DUF88  42.8 
 
 
312 aa  188  9e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000245308  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0659  hypothetical protein  43.15 
 
 
262 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11150  hypothetical protein  41.51 
 
 
314 aa  179  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.280093 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  54.48 
 
 
371 aa  177  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  41.94 
 
 
236 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2536  hypothetical protein  38.98 
 
 
313 aa  151  8.999999999999999e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13473  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1180  hypothetical protein  32.62 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0182  hypothetical protein  34.45 
 
 
232 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0199  hypothetical protein  33.8 
 
 
232 aa  128  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0220  hypothetical protein  34.45 
 
 
232 aa  128  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4909  hypothetical protein  32.92 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0665884  normal  0.351144 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  34.74 
 
 
251 aa  124  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  29.74 
 
 
229 aa  119  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  26.21 
 
 
334 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0356  hypothetical protein  41.58 
 
 
160 aa  89.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  29.25 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0857  protein of unknown function DUF88  39.71 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  28.31 
 
 
496 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  29.26 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3462  hypothetical protein  36.36 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0939176 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  28.63 
 
 
253 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  31.05 
 
 
498 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  31.05 
 
 
498 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  30.61 
 
 
440 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  30.61 
 
 
483 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  30.2 
 
 
472 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  30.61 
 
 
477 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  30.61 
 
 
483 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  28.21 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  31.73 
 
 
508 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  31.6 
 
 
498 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  28.27 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  28.27 
 
 
253 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  30.09 
 
 
480 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  30.23 
 
 
501 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  29.65 
 
 
478 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  29.36 
 
 
421 aa  76.3  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  30.77 
 
 
507 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  31.18 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  29.55 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  28.23 
 
 
564 aa  73.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  25.7 
 
 
311 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  25.7 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  25.7 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4443  hypothetical protein  24.35 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  25.7 
 
 
272 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  26.27 
 
 
319 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  27.78 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>