98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0763 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0763  ferredoxin  100 
 
 		 228 aa  464  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1698  ferredoxin  63.35 
 
 		 226 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684927 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2149  ferredoxin  60.71 
 
 		 226 aa  284  7e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  57.82 
 
 		 226 aa  263  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0768  ferredoxin  57.59 
 
 		 226 aa  256  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0876  ferredoxin  55.36 
 
 		 222 aa  254  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.931688  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  37.39 
 
 		 356 aa  142  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  37.91 
 
 		 349 aa  135  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  38.46 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  45.39 
 
 		 145 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  38.6 
 
 		 355 aa  128  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  37.64 
 
 		 355 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  40.88 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0765  ferredoxin  37.5 
 
 		 277 aa  119  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  38.42 
 
 		 360 aa  116  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0629  chlorosome envelope protein X  38.55 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0877  ferredoxin  41.83 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2148  ferredoxin  34.3 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  35.44 
 
 		 162 aa  104  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  31.9 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1298  ferredoxin, 2Fe-2S  40.26 
 
 		 111 aa  52.4  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.579463  normal  0.0110849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14800  ferredoxin (2Fe-2S)  33.77 
 
 		 112 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1329  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.36 
 
 		 112 aa  52  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0722  2Fe-2S ferredoxin  37.97 
 
 		 112 aa  51.6  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0282  ferredoxin  37.97 
 
 		 112 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000157042  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  35.44 
 
 		 101 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  35 
 
 		 578 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2419  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  38.96 
 
 		 111 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  35.63 
 
 		 113 aa  50.1  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2269  ferredoxin, 2Fe-2S  37.66 
 
 		 111 aa  49.3  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  34.88 
 
 		 652 aa  49.3  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0835  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.97 
 
 		 112 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.967876  normal  0.385713 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3022  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.33 
 
 		 111 aa  49.3  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3506  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.04 
 
 		 113 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2737  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.48 
 
 		 111 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2912  ferredoxin  34.48 
 
 		 111 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.50604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2693  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.48 
 
 		 111 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2778  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.48 
 
 		 111 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.189677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2800  ferredoxin  34.48 
 
 		 111 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1463  ferredoxin, 2Fe-2S type  37.66 
 
 		 111 aa  48.9  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0113872  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1109  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.63 
 
 		 111 aa  48.9  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.800718  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  34.18 
 
 		 580 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1152  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.48 
 
 		 111 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0789198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02381  hypothetical protein  34.48 
 
 		 111 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2900  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.48 
 
 		 111 aa  48.5  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1143  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.48 
 
 		 111 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716373  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2677  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.48 
 
 		 111 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.346484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3756  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.48 
 
 		 111 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0571302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2809  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.48 
 
 		 111 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.574088  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2676  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.48 
 
 		 111 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02417  [2Fe-2S] ferredoxin  34.48 
 
 		 111 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.486966  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1304  2Fe-2S ferredoxin  30.68 
 
 		 115 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.228876  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1057  ferredoxin  33.33 
 
 		 160 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2746  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.63 
 
 		 111 aa  48.5  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1086  ferredoxin  33.33 
 
 		 160 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  25.62 
 
 		 618 aa  48.5  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1173  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.48 
 
 		 111 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  30.43 
 
 		 821 aa  48.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0430  adrenodoxin family ferredoxin  34.48 
 
 		 111 aa  48.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877719 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1281  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.71 
 
 		 111 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1744  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.66 
 
 		 111 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1824  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.66 
 
 		 111 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00182317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2275  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.66 
 
 		 111 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000375139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3622  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.48 
 
 		 111 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.326058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1242  ferredoxin, 2Fe-2S type  35.44 
 
 		 113 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2144  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  37.66 
 
 		 112 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000150594  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  33.71 
 
 		 107 aa  45.8  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1243  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.71 
 
 		 112 aa  45.1  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1966  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.36 
 
 		 112 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000106789  hitchhiker  0.000349288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2497  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.36 
 
 		 112 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000131684  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2381  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.36 
 
 		 112 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000496454  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2392  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  36.36 
 
 		 112 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324586  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0598  ferredoxin  33.33 
 
 		 101 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0623  ferredoxin  32.56 
 
 		 101 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179547  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0678  ferredoxin, 2Fe-2S  30.67 
 
 		 112 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.215158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40350  Isc ferredoxin  30 
 
 		 113 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0827  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  30.67 
 
 		 112 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0161853  normal  0.598129 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0803  ferredoxin, 2Fe-2S type  35.53 
 
 		 113 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0632  ferredoxin  32.56 
 
 		 101 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  37.33 
 
 		 137 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3026  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  35.53 
 
 		 111 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1428  ferredoxin, 2Fe-2S  34.29 
 
 		 113 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1025  ferredoxin [2FE-2S] protein  34.21 
 
 		 112 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.304787 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  32.65 
 
 		 592 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.29 
 
 		 973 aa  43.5  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1249  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  34.21 
 
 		 111 aa  43.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.840287  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12138  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na translocating, F subunit  30.36 
 
 		 434 aa  43.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3190  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.840017 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  29.76 
 
 		 160 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3636  ferredoxin  36.25 
 
 		 98 aa  43.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.337263 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  29.89 
 
 		 549 aa  42.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  32.65 
 
 		 592 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2866  ferredoxin, 2Fe-2S  40.28 
 
 		 112 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000015343 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1169  ferredoxin, 2Fe-2S type  32.89 
 
 		 112 aa  42.7  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.797526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1458  putative (2Fe-2S) ferredoxin  32.98 
 
 		 118 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507702 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1662  ferredoxin (2Fe-2S)  36.51 
 
 		 128 aa  42  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0955  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 		 112 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.47066  normal  0.0577482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0890  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  32 
 
 		 112 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0444607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>