More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04506 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04506  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 143 aa  285  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.044915  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0509  50S ribosomal protein L6  78.32 
 
 		 175 aa  237  4e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.910827  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0448  50S ribosomal protein L6  74.83 
 
 		 175 aa  230  6e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.935491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0771  50S ribosomal protein L6  79.02 
 
 		 174 aa  228  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.787291  normal  0.0130716 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  66.91 
 
 		 177 aa  183  8e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0342  50S ribosomal protein L6  59.86 
 
 		 174 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.202734  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  59.44 
 
 		 176 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0512  50S ribosomal protein L6  59.86 
 
 		 174 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000124699  unclonable  0.0000000000161683 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  68.33 
 
 		 177 aa  174  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3053  50S ribosomal protein L6  63.24 
 
 		 176 aa  174  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000512294  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  59.56 
 
 		 178 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2357  50S ribosomal protein L6  61.11 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.700236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3154  50S ribosomal protein L6  62.5 
 
 		 176 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0206863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3789  50S ribosomal protein L6  62.5 
 
 		 176 aa  170  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2617  50S ribosomal protein L6  62.5 
 
 		 176 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00663642  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3761  50S ribosomal protein L6  62.5 
 
 		 176 aa  170  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0024508  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  61.76 
 
 		 177 aa  170  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1939  50S ribosomal protein L6  62.5 
 
 		 176 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0207492  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3731  50S ribosomal protein L6  62.5 
 
 		 176 aa  170  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000218121  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3493  50S ribosomal protein L6  62.5 
 
 		 176 aa  170  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  60.29 
 
 		 177 aa  169  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0338  ribosomal protein L6  58.45 
 
 		 175 aa  169  9e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  58.09 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2824  50S ribosomal protein L6  67.54 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0379678  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0264  50S ribosomal protein L6  61.03 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000279479  hitchhiker  0.0041278 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0329  50S ribosomal protein L6  68.42 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00323508  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3629  50S ribosomal protein L6  67.54 
 
 		 176 aa  168  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000298442  hitchhiker  0.0000000000176204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  55.86 
 
 		 177 aa  167  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0342  50S ribosomal protein L6  61.03 
 
 		 176 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157965  normal  0.0125773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2744  50S ribosomal protein L6  61.03 
 
 		 176 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000130297  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0363  50S ribosomal protein L6  61.03 
 
 		 176 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000934657  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1839  50S ribosomal protein L6  61.54 
 
 		 178 aa  167  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0352  50S ribosomal protein L6  61.54 
 
 		 178 aa  167  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0282  50S ribosomal protein L6  60.29 
 
 		 176 aa  167  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00574931  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0291  50S ribosomal protein L6  60.29 
 
 		 176 aa  167  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000875703  normal  0.0218003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  56.94 
 
 		 177 aa  166  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00953  50S ribosomal protein L6  70.18 
 
 		 177 aa  167  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0734749  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  56.94 
 
 		 177 aa  166  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0420  50S ribosomal protein L6  56.25 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146795  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  66.39 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3462  50S ribosomal protein L6  59.56 
 
 		 176 aa  165  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000287307  decreased coverage  0.00473222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0974  50S ribosomal protein L6  56.94 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234587  hitchhiker  0.00000109608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1004  50S ribosomal protein L6  69.3 
 
 		 177 aa  165  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00326754  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  58.09 
 
 		 177 aa  164  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  68.42 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  57.25 
 
 		 177 aa  162  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  65.55 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  56.94 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0334  50S ribosomal protein L6  58.7 
 
 		 176 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000427572  unclonable  0.0000000488908 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  65.55 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  65.55 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  65.55 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  66.67 
 
 		 177 aa  161  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  65.79 
 
 		 177 aa  161  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0294  50S ribosomal protein L6P  56.25 
 
 		 177 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000550047  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  67.54 
 
 		 177 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06400  50S ribosomal protein L6  64.71 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0011591  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  64.71 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  59.56 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  59.56 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  56.25 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3934  50S ribosomal protein L6  63.16 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0211  50S ribosomal protein L6  64.91 
 
 		 177 aa  157  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000116546  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4041  50S ribosomal protein L6  64.91 
 
 		 177 aa  157  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000805939  unclonable  0.00000000000307302 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  57.36 
 
 		 176 aa  157  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4155  50S ribosomal protein L6  64.91 
 
 		 177 aa  157  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000600192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0215  50S ribosomal protein L6  64.91 
 
 		 177 aa  157  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000103444  hitchhiker  0.000114271 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  55.64 
 
 		 178 aa  157  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  57.14 
 
 		 178 aa  156  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  65.79 
 
 		 177 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4302  50S ribosomal protein L6  55.4 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000025349  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  55.4 
 
 		 177 aa  155  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  62.28 
 
 		 177 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0173  50S ribosomal protein L6  55.4 
 
 		 176 aa  155  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111848  decreased coverage  0.0000538106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  56.2 
 
 		 177 aa  155  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  60.77 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  64.04 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0185  50S ribosomal protein L6  64.91 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922994  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0163  50S ribosomal protein L6  64.91 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  60.77 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0441  50S ribosomal protein L6  59.82 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296356  hitchhiker  0.000109216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  60.77 
 
 		 177 aa  154  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3744  50S ribosomal protein L6  64.04 
 
 		 177 aa  154  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640948  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  51.59 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0214  50S ribosomal protein L6  64.04 
 
 		 177 aa  154  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000010053  hitchhiker  0.00000000158568 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0246  50S ribosomal protein L6  64.04 
 
 		 177 aa  154  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0214  50S ribosomal protein L6  64.04 
 
 		 177 aa  154  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000958159  unclonable  0.0000000000152518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0209  50S ribosomal protein L6  64.04 
 
 		 177 aa  154  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000225303  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0409  50S ribosomal protein L6  58.2 
 
 		 179 aa  154  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0384  50S ribosomal protein L6  58.2 
 
 		 179 aa  154  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  58.82 
 
 		 177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  63.16 
 
 		 177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0499  50S ribosomal protein L6  50.69 
 
 		 177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000112242  normal  0.0683389 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  55.63 
 
 		 177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4675  50S ribosomal protein L6  56.59 
 
 		 176 aa  154  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105609  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  55.56 
 
 		 178 aa  153  6e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0782  ribosomal protein L6  55.07 
 
 		 177 aa  153  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000462697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1037  50S ribosomal protein L6  56.15 
 
 		 177 aa  152  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000958163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  54.14 
 
 		 179 aa  152  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>