36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04050 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  100 
 
 		 424 aa  835    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  41.2 
 
 		 310 aa  132  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  34.48 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  31.87 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  34.78 
 
 		 145 aa  75.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  34.86 
 
 		 217 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  29.68 
 
 		 295 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  36.31 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  34.09 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  38.18 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  42.27 
 
 		 140 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  32 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1213  RDD  38.04 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  27.12 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  30.46 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  30.49 
 
 		 202 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  29.38 
 
 		 166 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3589  Fimbrial protein pilin  42.11 
 
 		 252 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  25.83 
 
 		 137 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  27.57 
 
 		 202 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4968  YxaI  39.51 
 
 		 77 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  28.21 
 
 		 159 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  31.25 
 
 		 152 aa  50.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4478  RDD domain containing protein  25.93 
 
 		 242 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  29.41 
 
 		 154 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  26.06 
 
 		 211 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  28.49 
 
 		 154 aa  47.4  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3132  hypothetical protein  31.54 
 
 		 347 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  31.58 
 
 		 169 aa  46.6  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2360  hypothetical protein  46.67 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  27.85 
 
 		 156 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1651  hypothetical protein  43.1 
 
 		 187 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  29.38 
 
 		 166 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  36.54 
 
 		 152 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0115  hypothetical protein  31.53 
 
 		 157 aa  43.1  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.539233  hitchhiker  0.000011217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>