63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03779 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03779  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
99 aa  202  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  78.35 
 
 
293 aa  160  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  80 
 
 
293 aa  156  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  71.58 
 
 
639 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  67.74 
 
 
284 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  68.13 
 
 
284 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4031  Alpha/beta hydrolase  65.59 
 
 
284 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2561  alpha/beta hydrolase fold protein  64.65 
 
 
289 aa  128  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.192273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2688  alpha/beta hydrolase fold protein  64.52 
 
 
281 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  66.3 
 
 
290 aa  127  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  57.43 
 
 
336 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  62.92 
 
 
323 aa  120  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3323  alpha/beta hydrolase fold protein  58.33 
 
 
296 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  59.57 
 
 
297 aa  119  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  59.57 
 
 
308 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3479  alpha/beta hydrolase fold protein  57.29 
 
 
296 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  57.73 
 
 
336 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  60.87 
 
 
283 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  57.29 
 
 
334 aa  116  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  58.06 
 
 
289 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  54.74 
 
 
300 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  63.1 
 
 
356 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  54.84 
 
 
294 aa  110  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  56.52 
 
 
296 aa  110  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  55.56 
 
 
337 aa  110  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  53.12 
 
 
311 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  50.53 
 
 
323 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  54.44 
 
 
296 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  52.69 
 
 
300 aa  103  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  54.74 
 
 
323 aa  103  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0463  alpha/beta hydrolase fold protein  54.95 
 
 
296 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  51.61 
 
 
321 aa  100  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  52.75 
 
 
374 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  49.47 
 
 
321 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  48.96 
 
 
303 aa  98.2  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  44.44 
 
 
306 aa  97.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  51.58 
 
 
329 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  51.55 
 
 
290 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  51.55 
 
 
290 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  51.55 
 
 
290 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  52.17 
 
 
290 aa  94.7  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  46.32 
 
 
324 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  46.32 
 
 
287 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  48.45 
 
 
291 aa  90.1  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
315 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  45.92 
 
 
309 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  40.86 
 
 
335 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  43.96 
 
 
283 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  47.13 
 
 
323 aa  85.1  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0439  alpha/beta hydrolase fold protein  47.96 
 
 
293 aa  84.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.580414  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  42.11 
 
 
301 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2769  alpha/beta hydrolase fold protein  46.24 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39941  predicted protein  40.45 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454558  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  46.59 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  45.98 
 
 
290 aa  78.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 
289 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  41.49 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  42.39 
 
 
303 aa  73.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
297 aa  70.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3408  hypothetical protein  44.44 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337254  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6201  alpha/beta hydrolase fold protein  38.3 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3207  alpha/beta hydrolase fold protein  36.23 
 
 
294 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 
296 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>