116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03727 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03727  ISXoo2 transposase  100 
 
 
225 aa  454  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01793  ISXoo2 transposase  95.83 
 
 
350 aa  421  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  94.91 
 
 
352 aa  419  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  93.98 
 
 
352 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  95.37 
 
 
351 aa  414  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00308  ISXoo2 transposase  94.91 
 
 
347 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00643  transposase  93.98 
 
 
290 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02693  transposase  93.98 
 
 
262 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  93.98 
 
 
352 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  93.52 
 
 
352 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  93.52 
 
 
332 aa  408  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02876  ISXoo2 transposase  93.98 
 
 
324 aa  408  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  93.98 
 
 
352 aa  407  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  93.52 
 
 
332 aa  408  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01209  ISXoo2 transposase  93.52 
 
 
322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  93.06 
 
 
322 aa  404  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03936  transposase  92.56 
 
 
243 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03432  ISXoo2 transposase  91.67 
 
 
348 aa  392  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00315  ISXoo2 transposase  95.08 
 
 
219 aa  355  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03215  transposase  93.58 
 
 
233 aa  356  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04635  transposase  96.36 
 
 
176 aa  322  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.873282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04110  transposase  96.36 
 
 
176 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03387  transposase  95.15 
 
 
165 aa  318  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02350  ISXoo2 transposase  91.12 
 
 
293 aa  306  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.946418  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3582  transposase  58.33 
 
 
257 aa  248  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  47.66 
 
 
342 aa  189  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  47.66 
 
 
342 aa  189  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  47.66 
 
 
342 aa  189  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  42.86 
 
 
350 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  38.71 
 
 
345 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  38.71 
 
 
345 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  38.71 
 
 
345 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  38.71 
 
 
345 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  38.71 
 
 
345 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  38.71 
 
 
345 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  38.71 
 
 
345 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  38.71 
 
 
345 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  38.71 
 
 
345 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  38.71 
 
 
345 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  38.28 
 
 
311 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1154  ISXo7 transposase  38.43 
 
 
347 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1491  ISXo7 transposase  38.43 
 
 
352 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15454  hitchhiker  0.0000965463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1754  ISXo7 transposase  38.43 
 
 
352 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845612  normal  0.248762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2762  ISXo7 transposase  38.43 
 
 
352 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.430207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2525  ISXo7 transposase  38.43 
 
 
352 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2088  putative transposase  38.25 
 
 
342 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3678  transposase and inactivated derivatives  35.81 
 
 
344 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  38.6 
 
 
308 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  32.58 
 
 
348 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  32.58 
 
 
348 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  34.26 
 
 
345 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  34.26 
 
 
345 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  34.26 
 
 
345 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  32.13 
 
 
348 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  32.58 
 
 
348 aa  105  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  32.58 
 
 
348 aa  105  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  32.58 
 
 
348 aa  105  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  33.94 
 
 
350 aa  104  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  36.96 
 
 
314 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  33.49 
 
 
350 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03386  putative transposase  96 
 
 
68 aa  99.8  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.247589  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1739  ISXo7 transposase  31.02 
 
 
345 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04108  transposase  83.33 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04633  transposase  83.33 
 
 
144 aa  92  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2354  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.33 
 
 
345 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal  0.309704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.66 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.66 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.66 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.66 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.66 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.66 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.66 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0798  hypothetical protein  30.34 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03678  putative transposase  80.85 
 
 
56 aa  73.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3886  IS630 family transposase  32 
 
 
167 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00228342  normal  0.0587286 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1353  helix-turn-helix, type 11 domain protein  35.29 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3636  IS630 family transposase  29.05 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1655  ISAfe6, transposase  40 
 
 
230 aa  64.3  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4038  hypothetical protein  33.6 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0321009  normal  0.0191331 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3563  putative transposase  30.22 
 
 
298 aa  58.5  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0118  IS630 family transposase  30.41 
 
 
173 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4113  IS630 family transposase  30.41 
 
 
173 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3656  hypothetical protein  30.1 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8680  transposase, IS630 family  29.33 
 
 
181 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  28.33 
 
 
161 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  28.33 
 
 
161 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  28.33 
 
 
161 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  28.33 
 
 
161 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  28.33 
 
 
161 aa  50.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  28.33 
 
 
161 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.110681 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3105  ISAfe6, transposase, degenerate  39.19 
 
 
101 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0268483  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4510  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.47 
 
 
174 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  24.53 
 
 
355 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  24.53 
 
 
355 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  24.53 
 
 
355 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0365  helix-turn-helix Psq domain protein  23.86 
 
 
337 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.124969  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2669  helix-turn-helix Psq domain protein  23.86 
 
 
337 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374301  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1023  helix-turn-helix Psq domain protein  24.32 
 
 
152 aa  46.6  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2336  helix-turn-helix Psq domain protein  24.32 
 
 
152 aa  46.6  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.101417  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2500  helix-turn-helix Psq domain protein  24.32 
 
 
152 aa  46.6  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>