143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03436 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03436  neutral protease A  100 
 
 
207 aa  426  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0599  peptidase M4 thermolysin  68.02 
 
 
354 aa  283  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3601  peptidase M4 thermolysin  66.15 
 
 
341 aa  273  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.238334  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3006  peptidase M4 thermolysin  64.29 
 
 
347 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1125  peptidase M4 thermolysin  63.27 
 
 
349 aa  266  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00938174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7042  peptidase M4 thermolysin  66.15 
 
 
351 aa  265  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1266  peptidase M4 thermolysin  63.78 
 
 
347 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5252  peptidase M4 thermolysin  61.73 
 
 
356 aa  261  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0068319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3233  peptidase M4 thermolysin  62.81 
 
 
342 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.029325  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2731  peptidase M4 thermolysin  60.71 
 
 
357 aa  259  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00336587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2045  peptidase M4 thermolysin  62.44 
 
 
353 aa  259  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.912259 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1623  peptidase M4, thermolysin  61.11 
 
 
375 aa  252  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2537  peptidase M4, thermolysin  59.9 
 
 
348 aa  250  8.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2362  peptidase M4 thermolysin  59.18 
 
 
350 aa  249  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000736237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2629  peptidase M4, thermolysin  58.97 
 
 
347 aa  247  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.235261  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2947  peptidase M4, thermolysin  60.21 
 
 
360 aa  242  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4056  peptidase M4, thermolysin  59.69 
 
 
430 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30670  Zinc metalloprotease (elastase)  57.79 
 
 
547 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1188  peptidase M4 thermolysin  60.94 
 
 
403 aa  230  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3041  bacillolysin  51.5 
 
 
356 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0173986  normal  0.0722993 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3176  thermolysin metallopeptidase, putative  50.49 
 
 
356 aa  204  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1523  extracellular metalloprotease precursor protein  47.94 
 
 
351 aa  179  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103754  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0656  neutral protease Npr599  47.47 
 
 
566 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.833790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0727  neutral protease Npr599  47 
 
 
566 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0567  neutral protease  47.03 
 
 
566 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0599  neutral protease  47.03 
 
 
566 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0667  neutral protease  46.5 
 
 
566 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0670  Thermolysin  47.24 
 
 
546 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0638  neutral protease Npr599  46.5 
 
 
566 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4700  neutral protease Npr599  46.5 
 
 
566 aa  158  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0511  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  46.97 
 
 
566 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000111009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0515  thermolysin  46.5 
 
 
565 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000166027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0509  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  46.97 
 
 
566 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00722387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0514  thermolysin  46 
 
 
566 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0375  neutral protease  45.36 
 
 
556 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2661  zinc metalloproteinase aureolysin  43.88 
 
 
509 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2717  zinc metalloproteinase aureolysin  43.88 
 
 
509 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1599  peptidase M4 thermolysin  46.39 
 
 
556 aa  152  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000990098  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0042  neutral protease  46.39 
 
 
556 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000223504  normal  0.0464534 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2252  extracellular elastase precursor  42.86 
 
 
507 aa  149  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2213  peptidase M4 thermolysin  44.85 
 
 
556 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000134163  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3622  peptidase M4 thermolysin  41.92 
 
 
478 aa  145  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4907  neutral protease B  40.91 
 
 
552 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0061  neutral protease B  40.4 
 
 
556 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235216  hitchhiker  0.000405406 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0100  neutral protease, N-terminal region  45.26 
 
 
274 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0090986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5282  neutral protease B  40.91 
 
 
547 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.346731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3645  thermolysin  40.85 
 
 
532 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0278352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4752  neutral protease B  40.91 
 
 
554 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000177713  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4771  neutral protease B  40.91 
 
 
554 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5152  neutral protease B  40.91 
 
 
549 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000564161 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5197  neutral protease B  40.4 
 
 
591 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4867  peptidase M4 thermolysin  40.4 
 
 
549 aa  142  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5188  neutral protease B  39.9 
 
 
591 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.32835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5183  neutral protease B, bacillolysin  39.9 
 
 
591 aa  141  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00705702  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1208  metalloprotease  38.5 
 
 
1031 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0437  peptidase M4 thermolysin  44.07 
 
 
1017 aa  111  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00224619  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3166  griselysin  36.02 
 
 
527 aa  108  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  34.13 
 
 
924 aa  101  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  38.17 
 
 
984 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  31.94 
 
 
1154 aa  94.4  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04205  neutral protease A  35.03 
 
 
221 aa  92.4  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  36.14 
 
 
775 aa  92  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  34.55 
 
 
780 aa  91.7  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6312  peptidase M4 thermolysin  35.8 
 
 
759 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1667  peptidase M4 thermolysin  36.14 
 
 
791 aa  88.6  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123445  normal  0.274412 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  37.65 
 
 
777 aa  87.8  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7164  ZmpA peptidase  31.98 
 
 
565 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  35.8 
 
 
778 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  35.8 
 
 
778 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  35.8 
 
 
778 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  35.8 
 
 
778 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2464  extracellular neutral metalloprotease, bacillolysin  34.45 
 
 
567 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000399034  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  37.82 
 
 
701 aa  85.9  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2787  metalloendopeptidase  34.45 
 
 
567 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000221035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2415  thermolysin  33.97 
 
 
567 aa  85.1  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000428909  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2551  metalloendopeptidase  33.49 
 
 
567 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000846614  decreased coverage  0.0000000000277026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2762  neutral protease  33.49 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000113293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2499  extracellular neutral metalloprotease, bacillolysin  33.97 
 
 
567 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000144667  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1559  thermolysin metallopeptidase  31.67 
 
 
565 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.837695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2742  metalloendopeptidase  33.49 
 
 
567 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00888041  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0599  thermolysin metallopeptidase  31.67 
 
 
565 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2046  thermolysin metallopeptidase  31.67 
 
 
585 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2191  thermolysin metallopeptidase  31.67 
 
 
585 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.201777  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2104  thermolysin metallopeptidase  31.67 
 
 
585 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339655  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0724  thermolysin metallopeptidase  31.67 
 
 
565 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2738  metalloendopeptidase  33.97 
 
 
567 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.89181e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2543  neutral protease  33.97 
 
 
567 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000016311  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0532  zinc metalloproteinase precursor  33.33 
 
 
543 aa  83.2  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0020  hypothetical protein  31.55 
 
 
558 aa  83.2  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0508  zinc metalloproteinase precursor  33.33 
 
 
543 aa  83.2  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2730  neutral protease  33.97 
 
 
567 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476564  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0816  thermolysin metallopeptidase  31.67 
 
 
565 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273503  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3129  peptidase M4 thermolysin  39.22 
 
 
499 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2515  vibriolysin  38.51 
 
 
500 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.67369  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2583  vibriolysin  38.51 
 
 
500 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1201  peptidase M4, thermolysin  38.46 
 
 
485 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.913619  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07565  thermolysin  31.12 
 
 
1251 aa  81.3  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4301  peptidase M4 thermolysin  31.22 
 
 
565 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3836  propeptide, peptidase M4 and M36  31.22 
 
 
565 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.827362  normal  0.318438 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2681  vibriolysin  38.75 
 
 
500 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.161889 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>