144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4056 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4056  peptidase M4, thermolysin  100 
 
 
430 aa  840    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5252  peptidase M4 thermolysin  51.74 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0068319  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2362  peptidase M4 thermolysin  52.03 
 
 
350 aa  324  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000736237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3006  peptidase M4 thermolysin  48.06 
 
 
347 aa  323  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7042  peptidase M4 thermolysin  52.75 
 
 
351 aa  322  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2537  peptidase M4, thermolysin  51.79 
 
 
348 aa  316  6e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3233  peptidase M4 thermolysin  50 
 
 
342 aa  315  9e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.029325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1266  peptidase M4 thermolysin  47.16 
 
 
347 aa  312  6.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248028  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2629  peptidase M4, thermolysin  47.99 
 
 
347 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.235261  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0599  peptidase M4 thermolysin  50 
 
 
354 aa  310  2e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3601  peptidase M4 thermolysin  48.34 
 
 
341 aa  305  8.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.238334  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1125  peptidase M4 thermolysin  45.35 
 
 
349 aa  296  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00938174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2947  peptidase M4, thermolysin  45.4 
 
 
360 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1623  peptidase M4, thermolysin  46.85 
 
 
375 aa  293  5e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2045  peptidase M4 thermolysin  47.8 
 
 
353 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.912259 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2731  peptidase M4 thermolysin  44.48 
 
 
357 aa  286  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00336587  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30670  Zinc metalloprotease (elastase)  55.44 
 
 
547 aa  286  5e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1188  peptidase M4 thermolysin  45.56 
 
 
403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3041  bacillolysin  40.23 
 
 
356 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0173986  normal  0.0722993 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03436  neutral protease A  59.69 
 
 
207 aa  242  9e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3176  thermolysin metallopeptidase, putative  40.18 
 
 
356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1523  extracellular metalloprotease precursor protein  41.99 
 
 
351 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1599  peptidase M4 thermolysin  40.74 
 
 
556 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000990098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0670  Thermolysin  41.06 
 
 
546 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0375  neutral protease  39.09 
 
 
556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0042  neutral protease  39.51 
 
 
556 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000223504  normal  0.0464534 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2661  zinc metalloproteinase aureolysin  41.32 
 
 
509 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2717  zinc metalloproteinase aureolysin  41.32 
 
 
509 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0656  neutral protease Npr599  38.34 
 
 
566 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.833790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0567  neutral protease  38.34 
 
 
566 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0599  neutral protease  38.34 
 
 
566 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0515  thermolysin  36.49 
 
 
565 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000166027  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0100  neutral protease, N-terminal region  38.98 
 
 
274 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0090986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0667  neutral protease  41 
 
 
566 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238285  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2213  peptidase M4 thermolysin  36.89 
 
 
556 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000134163  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0638  neutral protease Npr599  41 
 
 
566 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0727  neutral protease Npr599  41 
 
 
566 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0509  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  41.5 
 
 
566 aa  149  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00722387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0511  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  41.5 
 
 
566 aa  149  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000111009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4700  neutral protease Npr599  41 
 
 
566 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5183  neutral protease B, bacillolysin  35.14 
 
 
591 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00705702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0514  thermolysin  40.5 
 
 
566 aa  146  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2252  extracellular elastase precursor  36.78 
 
 
507 aa  145  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0061  neutral protease B  37.1 
 
 
556 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235216  hitchhiker  0.000405406 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4867  peptidase M4 thermolysin  36.69 
 
 
549 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5197  neutral protease B  35.77 
 
 
591 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3622  peptidase M4 thermolysin  35.37 
 
 
478 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5282  neutral protease B  35.87 
 
 
547 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.346731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4907  neutral protease B  35.87 
 
 
552 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4752  neutral protease B  34.96 
 
 
554 aa  140  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000177713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5152  neutral protease B  34.96 
 
 
549 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000564161 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4771  neutral protease B  34.96 
 
 
554 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5188  neutral protease B  35.48 
 
 
591 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.32835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3645  thermolysin  37.1 
 
 
532 aa  133  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0278352  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1208  metalloprotease  33.6 
 
 
1031 aa  111  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3166  griselysin  35.04 
 
 
527 aa  111  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  29.43 
 
 
1154 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  35.2 
 
 
924 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  36.9 
 
 
775 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0437  peptidase M4 thermolysin  32.45 
 
 
1017 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00224619  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  34.48 
 
 
777 aa  100  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02509  protease  37.58 
 
 
673 aa  100  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  34.58 
 
 
780 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1201  peptidase M4, thermolysin  37.87 
 
 
485 aa  98.2  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.913619  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  37.5 
 
 
778 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  37.5 
 
 
778 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  37.5 
 
 
778 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6312  peptidase M4 thermolysin  37.42 
 
 
759 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  37.5 
 
 
778 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1667  peptidase M4 thermolysin  38.1 
 
 
791 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123445  normal  0.274412 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  37.35 
 
 
609 aa  94  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0532  zinc metalloproteinase precursor  30.25 
 
 
543 aa  93.6  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0508  zinc metalloproteinase precursor  30.25 
 
 
543 aa  93.6  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0020  hypothetical protein  30.18 
 
 
558 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  38.07 
 
 
774 aa  92.8  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  33.67 
 
 
984 aa  92.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3129  peptidase M4 thermolysin  37.5 
 
 
499 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2515  vibriolysin  35.54 
 
 
500 aa  90.5  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.67369  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2583  vibriolysin  35.54 
 
 
500 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0019  hypothetical protein  29.82 
 
 
558 aa  89.7  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8540  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  34.8 
 
 
889 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810503  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2681  vibriolysin  32.4 
 
 
500 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.161889 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07565  thermolysin  32.77 
 
 
1251 aa  87.4  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0380  neutral protease  32.14 
 
 
568 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000306257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16250  elastase LasB  35.96 
 
 
498 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3392  bacillolysin  32.84 
 
 
565 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000112359  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3789  peptidase M4, thermolysin  31.73 
 
 
910 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1397  elastase LasB  35.96 
 
 
498 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3189  neutral protease  31.63 
 
 
565 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000741792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3170  neutral protease (bacillolysin)  31.63 
 
 
565 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000070765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3408  bacillolysin  31.63 
 
 
565 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3442  neutral protease  31.63 
 
 
565 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3091  neutral protease (bacillolysin)  31.63 
 
 
565 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000299935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04205  neutral protease A  34.85 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  33.96 
 
 
701 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07560  thermolysin precursor  32.87 
 
 
1250 aa  78.2  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3049  hypothetical protein  33.73 
 
 
553 aa  77  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2748  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  32.5 
 
 
880 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.873421 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2906  hypothetical protein  34.38 
 
 
553 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2624  bacillolysin  28.23 
 
 
891 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000636329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>