175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00613 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00613  transposase  100 
 
 
261 aa  532  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03921  transposase  99.23 
 
 
261 aa  527  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03947  ISXoo4 transposase  96.17 
 
 
486 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03512  transposase  95.4 
 
 
261 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03221  transposase  95.4 
 
 
259 aa  503  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04446  tRNA nucleotidyltransferase  95.79 
 
 
713 aa  503  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0105255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03541  transposase  94.64 
 
 
423 aa  501  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497923  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03599  transposase  95.02 
 
 
259 aa  498  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03660  transposase  95.02 
 
 
259 aa  499  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03204  transposase  95.02 
 
 
259 aa  496  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01836  putative ISXoo4 transposase  94.25 
 
 
486 aa  494  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05578  IS1478 transposase  94.64 
 
 
259 aa  494  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00639  transposase  93.87 
 
 
259 aa  495  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02101  transposase  93.87 
 
 
344 aa  490  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01423  transposase  94.25 
 
 
259 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00701  putative ISXoo4 transposase  94.25 
 
 
486 aa  490  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04816  transposase  92.34 
 
 
306 aa  485  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06094  transposase (IS4 family) protein  93.49 
 
 
491 aa  483  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05628  transposase (IS4 family) protein  93.49 
 
 
491 aa  483  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03677  putative ISXoo4 transposase  95.95 
 
 
472 aa  474  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01802  putative ISXoo4 transposase  93.65 
 
 
477 aa  467  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01571  transposase  95.44 
 
 
362 aa  464  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03939  transposase  93.36 
 
 
268 aa  458  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.796315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02774  transposase  92.24 
 
 
302 aa  456  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03646  transposase  95.24 
 
 
267 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00902  transposase  93.16 
 
 
288 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00478777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02569  transposase  94.42 
 
 
388 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03350  ISXoo4 transposase  94.42 
 
 
458 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03291  transposase  93.42 
 
 
230 aa  433  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02255  transposase  94.08 
 
 
186 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02554  transposase  92.45 
 
 
162 aa  305  4.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0840457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03992  transposase  96.03 
 
 
151 aa  300  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02629  transposase  94.7 
 
 
151 aa  296  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02654  transposase  93.84 
 
 
189 aa  278  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03521  transposase  92.42 
 
 
130 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0672  transposase IS4  56.05 
 
 
442 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  55 
 
 
426 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  55.25 
 
 
440 aa  228  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  54.79 
 
 
440 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  54.79 
 
 
440 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  54.79 
 
 
440 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  54.79 
 
 
440 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  54.79 
 
 
440 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  54.79 
 
 
440 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  53.28 
 
 
426 aa  224  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  53.28 
 
 
426 aa  224  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0105  transposase, IS4 family protein  52.63 
 
 
495 aa  224  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0281  transposase, IS4 family protein  52.63 
 
 
495 aa  224  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0508  transposase, IS4 family protein  52.63 
 
 
495 aa  224  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1377  transposase, IS4 family protein  52.63 
 
 
495 aa  224  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3679  transposase, IS4 family protein  52.63 
 
 
495 aa  224  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06247  transposase  89.83 
 
 
128 aa  224  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100358  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01073  transposase  89.83 
 
 
128 aa  224  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  53.64 
 
 
448 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03661  ISXoo5 transposase  50.83 
 
 
491 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  55 
 
 
448 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0313  hypothetical protein  54.09 
 
 
287 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00319  transposase  50.41 
 
 
390 aa  218  7.999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03351  putative ISXoo5 transposase  50 
 
 
415 aa  215  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00229  ISXoo5 transposase  50 
 
 
491 aa  215  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01949  ISXoo5 transposase  50 
 
 
491 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02758  ISXoo5 transposase  50 
 
 
529 aa  215  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06224  ISXoo5 transposase  50 
 
 
491 aa  214  9e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01090  ISXoo5 transposase  50 
 
 
491 aa  214  9e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1771  putative transposase  53.21 
 
 
448 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  50.22 
 
 
415 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4205  transposase IS4 family protein  46.64 
 
 
451 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2758  transposase, IS4  46.82 
 
 
451 aa  201  8e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0869213  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3666  transposase IS4 family protein  46.29 
 
 
442 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.850388  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4246  hypothetical protein  48.79 
 
 
270 aa  195  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7278  transposase  52.55 
 
 
412 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3827  transposase IS4 family protein  48.07 
 
 
448 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5151  transposase IS4 family protein  48.07 
 
 
448 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0725  transposase IS4 family protein  48.07 
 
 
448 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4203  transposase, IS4  46.38 
 
 
231 aa  186  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1457  transposase, IS4 family protein  45.54 
 
 
460 aa  186  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00632  transposase  58.43 
 
 
408 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110086  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02558  transposase  94.12 
 
 
147 aa  182  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254439  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00697  transposase  57.23 
 
 
408 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3211  hypothetical protein  47.49 
 
 
280 aa  166  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375208  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7398  transposase IS4 family protein  60.14 
 
 
374 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.891617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2849  ISPg7, transposase  40.28 
 
 
438 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00953  transposase  93.15 
 
 
86 aa  143  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172202  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06213  transposase  93.15 
 
 
86 aa  143  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.846656  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0798  hypothetical protein  51.35 
 
 
166 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0461  ISPg7, transposase  34.26 
 
 
435 aa  126  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01849  transposase  87.3 
 
 
241 aa  115  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01376  hypothetical protein  88.71 
 
 
73 aa  115  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01960  transposase  41.38 
 
 
159 aa  111  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0186456  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01806  transposase  65.22 
 
 
339 aa  105  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03520  transposase  94.12 
 
 
51 aa  97.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3127  hypothetical protein  51.06 
 
 
115 aa  92  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3125  transposase, IS4 family protein  44.12 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0494  transposase, IS5 family, putative  32.46 
 
 
498 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2434  transposase, IS5 family, putative  32.46 
 
 
498 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0664  transposase, IS5 family, putative  32.46 
 
 
498 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1382  transposase, IS5 family, putative  32.46 
 
 
498 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0722  transposase, IS5 family, putative  32.46 
 
 
498 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000096619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1432  transposase, IS5 family, putative  32.46 
 
 
498 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0812  hypothetical protein  30.16 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>