118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00315 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00315  ISXoo2 transposase  100 
 
 
219 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01793  ISXoo2 transposase  96.35 
 
 
350 aa  374  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.52681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00941  ISXoo2 transposase  95.83 
 
 
332 aa  371  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04494  ISXoo2 transposase  96.35 
 
 
352 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04732  ISXoo2 transposase  96.35 
 
 
351 aa  373  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06106  ISXoo2 transposase  95.83 
 
 
332 aa  371  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02248  ISXoo2 transposase  94.27 
 
 
352 aa  368  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02693  transposase  94.27 
 
 
262 aa  367  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01209  ISXoo2 transposase  95.26 
 
 
322 aa  363  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02876  ISXoo2 transposase  94.27 
 
 
324 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03783  ISXoo2 transposase  93.23 
 
 
352 aa  364  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04741  ISXoo2 transposase  93.75 
 
 
352 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00796  ISXoo2 transposase  93.75 
 
 
352 aa  362  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0666145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01409  ISXoo2 transposase  93.68 
 
 
322 aa  360  7.0000000000000005e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00643  transposase  95.63 
 
 
290 aa  355  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288713  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03727  ISXoo2 transposase  95.08 
 
 
225 aa  355  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00308  ISXoo2 transposase  95.63 
 
 
347 aa  353  7.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.773634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03936  transposase  94.51 
 
 
243 aa  348  4e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03432  ISXoo2 transposase  90.1 
 
 
348 aa  340  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04110  transposase  95.98 
 
 
176 aa  338  4e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04635  transposase  95.98 
 
 
176 aa  337  8e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.873282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03215  transposase  94.16 
 
 
233 aa  296  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02350  ISXoo2 transposase  90.44 
 
 
293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.946418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03387  transposase  92.68 
 
 
165 aa  236  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3582  transposase  54.64 
 
 
257 aa  198  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.314242 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0408  transposase  47.22 
 
 
342 aa  158  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0602  transposase  47.22 
 
 
342 aa  158  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0609  transposase  47.22 
 
 
342 aa  158  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0517216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2604  transposase  42.62 
 
 
350 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00818  ISXo7 transposase  37.89 
 
 
345 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00495  ISXo7 transposase  37.89 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01674  ISXo7 transposase  37.89 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.196408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02314  ISXo7 transposase  37.89 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03528  ISXo7 transposase  37.89 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03647  ISXo7 transposase  37.89 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03983  ISXo7 transposase  37.89 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04201  ISXo7 transposase  37.89 
 
 
345 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04716  ISXo7 transposase  37.89 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04844  ISXo7 transposase  37.89 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.420785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03386  putative transposase  94.92 
 
 
68 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.247589  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36420  transposase  35.2 
 
 
311 aa  106  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1154  ISXo7 transposase  36.6 
 
 
347 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1491  ISXo7 transposase  36.6 
 
 
352 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15454  hitchhiker  0.0000965463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1754  ISXo7 transposase  36.6 
 
 
352 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845612  normal  0.248762 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2762  ISXo7 transposase  36.6 
 
 
352 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.430207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2525  ISXo7 transposase  36.6 
 
 
352 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1153  transposase and inactivated derivatives  34.24 
 
 
348 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2139  transposase and inactivated derivatives  34.24 
 
 
348 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2088  putative transposase  37.84 
 
 
342 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219906  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0806  transposase and inactivated derivatives  36.71 
 
 
348 aa  96.3  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1307  transposase and inactivated derivatives  36.71 
 
 
348 aa  96.3  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1483  transposase and inactivated derivatives  36.71 
 
 
348 aa  96.3  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2134  transposase and inactivated derivatives  33.7 
 
 
348 aa  95.9  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0068506  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3678  transposase and inactivated derivatives  34.38 
 
 
344 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03678  putative transposase  82.14 
 
 
56 aa  87.8  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0418  ISXo7 transposase  32.78 
 
 
345 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0871  ISXo7 transposase  32.78 
 
 
345 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1393  ISXo7 transposase  32.78 
 
 
345 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.0201897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3724  ISXo7 transposase  35.81 
 
 
314 aa  85.1  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0606441  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0798  hypothetical protein  29.78 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2354  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  34.05 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal  0.309704 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0320  transposase and inactivated derivatives  32.78 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.702958  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2612  transposase and inactivated derivatives  32.78 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.903435  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7653  putative transposase  35.25 
 
 
308 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.902261  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1739  ISXo7 transposase  29.38 
 
 
345 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3886  IS630 family transposase  32.67 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00228342  normal  0.0587286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0170  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.48 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280686  hitchhiker  0.0000000148943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2324  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.48 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0314919  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1707  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.48 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0909  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.48 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5275  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.48 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962663  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4314  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.48 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0708959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3194  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.48 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329785  normal  0.95416 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3636  IS630 family transposase  30.72 
 
 
160 aa  67.8  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4038  hypothetical protein  33.6 
 
 
230 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0321009  normal  0.0191331 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0118  IS630 family transposase  30.3 
 
 
173 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4113  IS630 family transposase  30.3 
 
 
173 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8680  transposase, IS630 family  30.46 
 
 
181 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3656  hypothetical protein  30.1 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0002  transposase and inactivated derivative  28.7 
 
 
161 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1345  transposase and inactivated derivative  28.7 
 
 
161 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.738368  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1360  transposase and inactivated derivative  28.7 
 
 
161 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1512  transposase and inactivated derivative  29.17 
 
 
161 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.110681 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2699  transposase and inactivated derivative  28.7 
 
 
161 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3194  transposase and inactivated derivative  28.7 
 
 
161 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0365  helix-turn-helix Psq domain protein  24.43 
 
 
337 aa  50.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.124969  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2669  helix-turn-helix Psq domain protein  24.43 
 
 
337 aa  50.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374301  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1023  helix-turn-helix Psq domain protein  25 
 
 
152 aa  49.3  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2336  helix-turn-helix Psq domain protein  25 
 
 
152 aa  49.3  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.101417  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2414  helix-turn-helix Psq domain protein  25 
 
 
152 aa  49.3  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.203324  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2500  helix-turn-helix Psq domain protein  25 
 
 
152 aa  49.3  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2562  helix-turn-helix Psq domain protein  25 
 
 
152 aa  49.3  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2855  helix-turn-helix Psq domain protein  25 
 
 
152 aa  49.3  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00593097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3563  putative transposase  28.57 
 
 
298 aa  48.9  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4510  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.91 
 
 
174 aa  48.9  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1868  IS630 family transposase  36.11 
 
 
179 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.8029  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0727  hypothetical protein  27.5 
 
 
199 aa  46.6  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.172547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0197  Integrase catalytic region  23.94 
 
 
355 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1655  Integrase catalytic region  23.94 
 
 
355 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2569  Integrase catalytic region  23.94 
 
 
355 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>