25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4006 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4006  tail fiber protein H, putative  100 
 
 		 808 aa  1630    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  60.17 
 
 		 654 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  59.89 
 
 		 654 aa  422  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  37.69 
 
 		 689 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2748  hypothetical protein  43.11 
 
 		 527 aa  224  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1451  hypothetical protein  41.84 
 
 		 465 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.331514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1045  tail fiber protein  40.57 
 
 		 690 aa  215  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  38.29 
 
 		 701 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  40 
 
 		 670 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  40 
 
 		 670 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0257  hypothetical protein  40 
 
 		 609 aa  205  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  33.51 
 
 		 589 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0740  hypothetical protein  34.88 
 
 		 804 aa  157  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0930  tail fiber repeat 2-containing protein  33.15 
 
 		 531 aa  154  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1302  hypothetical protein  29.89 
 
 		 768 aa  150  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05044  hypothetical protein  45.86 
 
 		 268 aa  146  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1037  hypothetical protein  28.21 
 
 		 612 aa  107  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0716  hypothetical protein  37.69 
 
 		 249 aa  97.8  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.716987  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0570  hypothetical protein  35.03 
 
 		 190 aa  94  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.2378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  37.3 
 
 		 691 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3858  tail fiber protein, putative  44.62 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.642523  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  52.94 
 
 		 554 aa  54.3  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3500  hypothetical protein  50 
 
 		 899 aa  51.6  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  39.39 
 
 		 817 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  44 
 
 		 714 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>