More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2940 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2940  thiolase family protein  100 
 
 		 413 aa  827    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2725  thiolase  85.78 
 
 		 420 aa  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378058  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2050  acetyl-CoA acetyltransferase  70.1 
 
 		 413 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2403  acetyl-CoA acetyltransferase  70.9 
 
 		 413 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14260  beta-ketothiolase  64.23 
 
 		 416 aa  515  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00172773  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3355  beta-ketothiolase  72.08 
 
 		 396 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0797  acetyl-CoA acetyltransferases  56.69 
 
 		 416 aa  435  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0749989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3113  Acetyl-CoA C-acyltransferase  55.5 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.601433  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0040  acetyl-CoA acetyltransferase  52.9 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.632212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0272  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  52.8 
 
 		 416 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2491  acetyl-CoA acetyltransferase  49.51 
 
 		 423 aa  363  4e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2284  acetyl-CoA acetyltransferase  38.96 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3041  acetyl-CoA acetyltransferase  38.86 
 
 		 392 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0080  acetyl-CoA acetyltransferase  38.77 
 
 		 398 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0068  acetyl-CoA acetyltransferase  38.52 
 
 		 398 aa  242  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1668  acetyl-CoA acetyltransferase  38.92 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0062  acetyl-CoA acetyltransferase  39.6 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45947  predicted protein  38.01 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0064  acetyl-CoA acetyltransferase  38.12 
 
 		 402 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  40.38 
 
 		 404 aa  232  9e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  37.93 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  37.41 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  36.39 
 
 		 391 aa  229  8e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  36.59 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  36.14 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  36.43 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  35.64 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  35.64 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  35.64 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  35.64 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  37.62 
 
 		 401 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  35.64 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  35.64 
 
 		 391 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  36.23 
 
 		 396 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  35.64 
 
 		 391 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2722  acetyl-CoA acetyltransferase  35.4 
 
 		 391 aa  226  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  36.19 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  36.95 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3319  acetyl-CoA acetyltransferase  36.23 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  35.64 
 
 		 391 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2213  acetyl-CoA acetyltransferase  36.7 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000256776  normal  0.0132753 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  37.72 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  38.7 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  35.15 
 
 		 391 aa  223  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  37.23 
 
 		 397 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18000  acetyl-CoA acetyltransferase  36.7 
 
 		 393 aa  222  8e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.425657  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1169  acetyl-CoA acetyltransferase  34.22 
 
 		 400 aa  222  8e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.178123 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  37.23 
 
 		 397 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  36.67 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  37.32 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  37.28 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  38.92 
 
 		 393 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0529  Acetyl-CoA acetyltransferase  36.05 
 
 		 384 aa  219  5e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  37.32 
 
 		 397 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  34.79 
 
 		 393 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  37.07 
 
 		 409 aa  219  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  36.19 
 
 		 392 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  38.39 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.59343  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  35.12 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  37.07 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1802  acetyl-CoA acetyltransferase  37.32 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  37.07 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1236  acetyl-CoA acetyltransferase  33.5 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.439957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  34.39 
 
 		 393 aa  217  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  35.64 
 
 		 394 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  37.38 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  35.71 
 
 		 394 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0022  beta-ketothiolase  38.42 
 
 		 400 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  34.55 
 
 		 393 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  34.55 
 
 		 393 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  35.71 
 
 		 392 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  34.88 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.46 
 
 		 401 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  34.55 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  34.55 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  34.55 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  34.55 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  36.19 
 
 		 392 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  34.55 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  34.88 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  35.63 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  35.98 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  38.57 
 
 		 402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  36.88 
 
 		 393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  34.56 
 
 		 393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  34.98 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  34.98 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1354  beta-ketothiolase  38.02 
 
 		 389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  34.39 
 
 		 393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  34.98 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  37.62 
 
 		 395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  34.82 
 
 		 412 aa  213  5.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  34.98 
 
 		 427 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  34.73 
 
 		 427 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  35.21 
 
 		 392 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3331  beta-ketothiolase  36.07 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 		 402 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1134  acetyl-CoA acetyltransferase  33.82 
 
 		 398 aa  212  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3299  acetyl-CoA acetyltransferase  36.95 
 
 		 392 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  33.41 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>