More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2708 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  100 
 
 		 301 aa  631  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  97.01 
 
 		 307 aa  617  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  85.95 
 
 		 301 aa  550  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  75.08 
 
 		 301 aa  484  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  73 
 
 		 301 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  71.91 
 
 		 301 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  74.13 
 
 		 287 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  57.93 
 
 		 299 aa  351  7e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  47.4 
 
 		 298 aa  282  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 315 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0499  AraC family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2436  AraC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0731  AraC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 328 aa  242  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.617247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  45.72 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 329 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2069  AraC family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 329 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020463  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1906  AraC family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 329 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.166677  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3237  transcriptional regulator, AraC family  41.94 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.434177  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1199  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 329 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33488  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1643  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 329 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0305  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 329 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.183082  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0855  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 329 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 315 aa  235  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1116  transcriptional regulator, AraC family  47.06 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4594  transcriptional regulator, AraC family  40.28 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6320  transcriptional regulator, AraC family  40.28 
 
 		 294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.636258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  38.93 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3808  AraC family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 321 aa  229  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 319 aa  229  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 319 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 319 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  44.78 
 
 		 308 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 319 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 319 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5065  AraC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 312 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289747  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5795  AraC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 312 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3070  AraC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4384  AraC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1174  AraC family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16600  transcriptional regulator, AraC family  38.25 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 303 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0236  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 339 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0070  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 332 aa  215  8e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0349  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 332 aa  215  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1237  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 332 aa  215  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.89016  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1078  AraC family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 318 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.441231  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1744  AraC family transcription regulator  38.75 
 
 		 350 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109239  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1655  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 350 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365127  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2471  transcriptional regulator, AraC family  39.36 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0153728 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6660  AraC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 297 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0345  transcriptional regulator, AraC family  40.86 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4811  helix-turn-helix, AraC type  38.52 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0365  transcriptional regulator, AraC family  38.52 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0895  AraC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1710  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.492868 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20280  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0229385  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.31 
 
 		 319 aa  189  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3229  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 326 aa  178  9e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.686696 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  37.55 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0681  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  32.76 
 
 		 289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4971  transcriptional regulator, AraC family  34.97 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  hitchhiker  0.0000000000361988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0251  AraC family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1701  AraC family DNA-binding protein  30.6 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5736  transcriptional regulator, AraC family  33.59 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.458087  normal  0.0804567 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0737  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.42 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0508  transcriptional regulator, AraC family  35.36 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3988  transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  normal  0.630817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5348  transcriptional regulator, AraC family  31.9 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.226075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4043  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 288 aa  145  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0565  AraC family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 289 aa  145  9e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2813  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.96 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2340  helix-turn-helix domain-containing protein  28.77 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1667  transcriptional regulator, AraC family  32.42 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2939  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.38 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806864  normal  0.433201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.19 
 
 		 289 aa  136  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  30.45 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  30.1 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0862  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000330517  normal  0.0669751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2701  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.63 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.485012  normal  0.370839 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4642  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  30.04 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  30.56 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2146  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 325 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3317  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6330  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.361086 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3833  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.699646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5587  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.425806  normal  0.825086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4378  transcriptional regulator, AraC family  29.69 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  hitchhiker  0.00146244 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4427  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4283  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>