70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2046 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2046  ARD/ARD' family protein  100 
 
 		 181 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00213486  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1856  acireductone dioxygenase, ARD  97.24 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0338942  normal  0.893341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1725  acireductone dioxygenase, ARD  90.06 
 
 		 201 aa  346  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3588  putative oxidase  77.35 
 
 		 181 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42730  putative oxidase  76.8 
 
 		 181 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23790  Acireductone dioxygenase, ARD  69.61 
 
 		 181 aa  263  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2624  Acireductone dioxygenase ARD  58.66 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0608  hypothetical protein  54.75 
 
 		 180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.938645 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0908  acireductone dioxygenase, ARD  56.67 
 
 		 185 aa  217  7.999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1781  Acireductone dioxygenase ARD  56.74 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.242318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1141  acireductone dioxygenase, ARD  58.1 
 
 		 180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1344  acireductone dioxygenase ARD  56.18 
 
 		 188 aa  211  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3301  Acireductone dioxygenase ARD  54.75 
 
 		 181 aa  210  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0920  Acireductone dioxygenase ARD  54.19 
 
 		 180 aa  209  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1411  methionine salvage pathway enzyme  55.06 
 
 		 188 aa  208  4e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06080  dioxygenase  53.93 
 
 		 188 aa  207  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00847  dioxygenase  53.93 
 
 		 188 aa  207  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00184513  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3455  Acireductone dioxygenase ARD  52.78 
 
 		 181 aa  203  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0798  ARD/ARD' family dioxygenase  53.04 
 
 		 186 aa  200  9e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.665186  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0887  Acireductone dioxygenase ARD  51.4 
 
 		 180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.266171  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0944  acireductone dioxygenase ARD  51.67 
 
 		 180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3180  ARD/ARD' family dioxygenase  50.28 
 
 		 180 aa  193  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3329  ARD/ARD' family dioxygenase  50.28 
 
 		 180 aa  193  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.780596 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3319  acireductone dioxygenase ARD  50.28 
 
 		 180 aa  192  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2021  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like  47.85 
 
 		 186 aa  185  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1853  acireductone dioxygenase ARD  51.09 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0739842  normal  0.0828134 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0018  acireductone dioxygenase, ARD  48.59 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0651  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2' -like  47.31 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.573573  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21601  methionine salvage pathway enzyme E-2/E-2'-like protein  46.74 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0740094 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1513  Acireductone dioxygenase ARD  47.51 
 
 		 183 aa  175  4e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.354648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2511  putative oxidase  48.63 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2725  Acireductone dioxygenase ARD  47.95 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1549  Acireductone dioxygenase ARD  46.78 
 
 		 173 aa  168  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.529174  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1440  oxidase  44.2 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0261335 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1414  Acireductone dioxygenase ARD  46.15 
 
 		 179 aa  158  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1884  hypothetical protein  46.37 
 
 		 178 aa  159  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1832  oxidase, putative  43.75 
 
 		 178 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1410  oxidase  45.14 
 
 		 178 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3878  hypothetical protein  43.75 
 
 		 178 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0218712  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0987  Acireductone dioxygenase ARD  42.47 
 
 		 189 aa  137  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1265  Acireductone dioxygenase ARD  35.15 
 
 		 179 aa  105  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4106  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase, putative  32.37 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0853  Acireductone dioxygenase ARD  33.12 
 
 		 180 aa  95.5  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4170  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  32.37 
 
 		 170 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4148  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  32.95 
 
 		 170 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4060  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  32.76 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3796  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  32.76 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3949  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  32.76 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3781  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  31.79 
 
 		 170 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4258  5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  32.76 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1090  putative 5-methylthio-3-oxo-1-penten-1,2-diol dioxygenase  32.37 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1748  Acireductone dioxygenase ARD  31.87 
 
 		 180 aa  92  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0094  Acireductone dioxygenase ARD  41.53 
 
 		 181 aa  91.7  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00113178  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2738  acireductone dioxygenase ARD  32.28 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00558857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3868  acireductone dioxygenase ARD  31.93 
 
 		 170 aa  89.4  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4156  Acireductone dioxygenase ARD  31.58 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0433  dioxygenase, ARD/ARD' family  31.1 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0595  Acireductone dioxygenase ARD  31.1 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.415363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4249  Acireductone dioxygenase ARD  32.39 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1146  Acireductone dioxygenase ARD  27.61 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1176  Acireductone dioxygenase ARD  27.61 
 
 		 182 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2668  acireductone dioxygenase, ARD  23.49 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.564741 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4291  hypothetical protein  23.78 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2596  Acireductone dioxygenase ARD  32.46 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332409  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3175  acireductone dioxygenase ARD  31.4 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178399  hitchhiker  0.00313013 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25000  predicted protein  27.27 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.19447  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03570  hypothetical protein  29.17 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874392  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37619  conserved hypothetical protein  30.93 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06576  ARD/ARD family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04430)  29.46 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0679  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0775  hypothetical protein  31.08 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.123063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>