152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6290 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6290  putative cytochrome  100 
 
 		 97 aa  202  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72470  putative cytochrome  97.94 
 
 		 97 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.240625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0156  cytochrome c5-like protein  67.71 
 
 		 96 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0054  cytochrome c-type protein  81.01 
 
 		 90 aa  141  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3332  cytochrome c-type protein  67.71 
 
 		 96 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5103  cytochrome c-type protein  68.09 
 
 		 100 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0140  cytochrome c-type protein  65.96 
 
 		 100 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0125  cytochrome c-type protein  65.96 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0350268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0142  cytochrome c5-like protein  65.96 
 
 		 100 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2981  cytochrome c-type protein  65.62 
 
 		 95 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2849  cytochrome c family protein  54.26 
 
 		 95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000128252  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3568  cytochrome c, class I  55.67 
 
 		 97 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0232  cytochrome c, class I  52.58 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  unclonable  0.0000000000238576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0227  cytochrome c, class I  52.58 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.495989  hitchhiker  0.00493696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0232  cytochrome c, class I  52.58 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0199425  unclonable  0.0000000000331566 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0232  cytochrome c class I  51.55 
 
 		 99 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000496502  normal  0.108907 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0180  cytochrome c, class I  52.58 
 
 		 97 aa  103  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245077  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0264  cytochrome c  50.52 
 
 		 99 aa  103  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0216  cytochrome c class I  51.55 
 
 		 97 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0309264  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0229  cytochrome c class I  49.48 
 
 		 99 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000537114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0229  cytochrome c class I  49.48 
 
 		 99 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000024603  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4023  cytochrome c class I  49.48 
 
 		 99 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000136046  hitchhiker  0.0000237935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3726  cytochrome c, class I  49.47 
 
 		 99 aa  100  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.334938  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0246  cytochrome c  50.52 
 
 		 97 aa  99.4  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00117918  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0191  cytochrome c, class I  54.55 
 
 		 97 aa  93.6  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000235852  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3650  cytochrome c class I  44.57 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4658  cytochrome c, class I  47.42 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774786 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4286  cytochrome c, class I  47.44 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419984 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0183  cellulose binding, type IV  43.9 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.314607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0286  putative cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.721199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0461  cytochrome c, class I  47.22 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.943206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2556  cytochrome c5  45.33 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0095  cytochrome c family protein  46.07 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0170  cytochrome c, class I  42.25 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0260  cytochrome c, class I  39.56 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70340  putative cytochrome c(mono-heme type)  46.38 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0093  cytochrome c  46.58 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0144946  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00484  cb-type cytochrome oxidase subunit III  44.74 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001977  cytochrome c5  43.42 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000375428  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0459  cytochrome c, class I  46.67 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0072  cytochrome c, class I  46.48 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2000  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0804521  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0425  cytochrome C, class I  44.16 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.501458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2493  cytochrome c(mono-heme type)  40.28 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0117122  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1890  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3877  cytochrome c, class I  41.86 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1741  cytochrome c  40.28 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00078  cytochrome c5  43.06 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2655  hypothetical protein  38.89 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 273 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0605  cytochrome c, class I  38.89 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00227735  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2786  hypothetical protein  38.89 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0203  cytochrome c5  43.24 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.768078  hitchhiker  0.00155687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6104  putative cytochrome c(mono-heme type)  46.38 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415894  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1247  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  40.28 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5177  cytochrome c5  41.89 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129919  normal  0.155967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5267  cytochrome c5  41.89 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47940  cytochrome c5 protein  45.07 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0205  cytochrome c, class I  40.28 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.641753  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0971  hypothetical protein  40.7 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0941  hypothetical protein  40.7 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5522  cytochrome c5  40.54 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6074  cytochrome c5  41.1 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69970  cytochrome c5  41.1 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5319  cytochrome c5  40.54 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0106  cytochrome c5  37.37 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0239  cytochrome c5  38.78 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0033  cytochrome c, class I  45.59 
 
 		 167 aa  62  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.198707  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3876  cytochrome c class I  39.51 
 
 		 300 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0153  cytochrome c-555, membrane-bound  37.14 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170393  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0250  cytochrome c class I  40.85 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000296226  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2999  cytochrome c class I  36.67 
 
 		 319 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0221845 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0146  cytochrome c5  38.89 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0336  cytochrome c, class I  40 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1715  hypothetical protein  36.99 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128981  normal  0.195089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1062  cytochrome c class I  37.33 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0654  cytochrome c class I  35.9 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0061  cytochrome c family protein  37.04 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4834  cytochrome c class I  50.91 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.62683  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1141  cytochrome c, class I  37.33 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828692  normal  0.616371 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1398  putative cytochrome c-type protein  37.84 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0906233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0996  cytochrome c class I  38.04 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0249  cytochrome c5-like protein  38.03 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0233  cytochrome c, class I  38.03 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0215738  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2963  hypothetical protein  35.14 
 
 		 537 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2812  hypothetical protein  35.14 
 
 		 537 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3859  cytochrome c5  34.62 
 
 		 206 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000764521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2304  cytochrome c class I  32.26 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000896467  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03815  cytochrome C5  35.44 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0362  cytochrome c5-like protein  38.03 
 
 		 195 aa  57  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000104978  hitchhiker  0.00044408 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3003  cytochrome c family protein  36.47 
 
 		 299 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0213  hypothetical protein  37.14 
 
 		 173 aa  57  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000412444  hitchhiker  0.00201322 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0120  cytochrome c family protein  36.47 
 
 		 299 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3302  cytochrome c family protein  36.47 
 
 		 299 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.933009  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1534  cytochrome c family protein  36.47 
 
 		 299 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3918  cytochrome c5  36.47 
 
 		 299 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00486957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3990  cytochrome c family protein  36.47 
 
 		 299 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3068  cytochrome c family protein  36.47 
 
 		 275 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0840  putative cytochrome c5  35.62 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.674138  normal  0.844917 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0200  cytochrome c class I  32.56 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.657824  normal  0.710005 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>