More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5254 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  65.64 
 
 
509 aa  670    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  66.07 
 
 
511 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  66.27 
 
 
516 aa  662    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  66.27 
 
 
511 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  62.18 
 
 
513 aa  639    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  100 
 
 
517 aa  1060    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  66.27 
 
 
505 aa  662    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  63.86 
 
 
509 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  65.02 
 
 
513 aa  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  65.02 
 
 
513 aa  654    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  66.47 
 
 
511 aa  664    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  60.4 
 
 
507 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  63.21 
 
 
515 aa  636    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  61.4 
 
 
512 aa  633  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  59.88 
 
 
507 aa  628  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  60.91 
 
 
510 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  59.35 
 
 
510 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  61.26 
 
 
504 aa  617  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  61.24 
 
 
506 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  61.44 
 
 
506 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1188  catalase  58.61 
 
 
567 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  60.61 
 
 
503 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3629  catalase  59.44 
 
 
511 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.371952  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4468  catalase  59.44 
 
 
511 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.30476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3898  catalase  59.44 
 
 
511 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06580  catalase  59.27 
 
 
504 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  58.27 
 
 
527 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2194  catalase  59.2 
 
 
511 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0287639  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0377  catalase  58.27 
 
 
510 aa  590  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000005607  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1107  catalase  54.92 
 
 
536 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610456  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0466  catalase precursor  69.69 
 
 
562 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0874  catalase  55.05 
 
 
488 aa  541  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000610076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  54.71 
 
 
488 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  54.71 
 
 
488 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  54.71 
 
 
488 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  54.71 
 
 
488 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  54.71 
 
 
488 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  54.1 
 
 
488 aa  536  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  54.51 
 
 
488 aa  538  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  54.3 
 
 
488 aa  531  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4132  catalase  53.69 
 
 
488 aa  530  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000220587  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  56.98 
 
 
449 aa  520  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2728  catalase  48.24 
 
 
543 aa  459  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101027  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2900  Catalase  47.44 
 
 
550 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478184  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  46.15 
 
 
507 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  46.73 
 
 
498 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  46.99 
 
 
493 aa  422  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3172  catalase  44.08 
 
 
546 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0893  catalase  46.11 
 
 
489 aa  420  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  47.49 
 
 
481 aa  422  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  46.41 
 
 
505 aa  420  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3405  Catalase  47.18 
 
 
529 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2940  catalase  43.67 
 
 
546 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2914  catalase  43.67 
 
 
546 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2865  catalase  43.47 
 
 
546 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3164  catalase  43.67 
 
 
546 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3534  Catalase  47.08 
 
 
530 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3182  catalase  43.47 
 
 
546 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3210  catalase  47.08 
 
 
530 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161662  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  45.97 
 
 
479 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  46.19 
 
 
479 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  46.15 
 
 
484 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0632  catalase  46.68 
 
 
529 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172483  normal  0.22011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  46.19 
 
 
479 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  46.68 
 
 
529 aa  412  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  46.28 
 
 
529 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  45.16 
 
 
554 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0563  catalase  45.3 
 
 
486 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0894  catalase  44.74 
 
 
491 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3591  catalase  44.95 
 
 
491 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2125  Catalase  45.69 
 
 
555 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3190  catalase  44.17 
 
 
486 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0631825  normal  0.81248 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3468  catalase  44.54 
 
 
491 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.482946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3392  Catalase  44.54 
 
 
491 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  44.29 
 
 
504 aa  405  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  45.55 
 
 
479 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1070  catalase  45.23 
 
 
486 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5497  Catalase  43.14 
 
 
552 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0638  catalase  43.92 
 
 
487 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3029  catalase  44.81 
 
 
486 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0945  catalase  44.81 
 
 
486 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0885996  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2941  catalase  45.79 
 
 
488 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  43.12 
 
 
493 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0908  catalase domain-containing protein  44.61 
 
 
486 aa  398  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161902  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1932  catalase  43.34 
 
 
488 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21110  catalase  44 
 
 
487 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218837 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001311  catalase  43.34 
 
 
479 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0020  Catalase  43.6 
 
 
552 aa  393  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0935072 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1574  hypothetical protein  41.78 
 
 
501 aa  391  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0310454 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05192  catalase  43.07 
 
 
478 aa  392  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3018  catalase  43.24 
 
 
485 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1242  Catalase  43.49 
 
 
480 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122794 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3881  catalase  42.7 
 
 
480 aa  388  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000327701  hitchhiker  0.000000338063 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1387  catalase  43.13 
 
 
474 aa  385  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000679986  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  43.92 
 
 
695 aa  388  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4417  Catalase  44.79 
 
 
490 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0279064  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0864  catalase  42.53 
 
 
482 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09150  catalase  42.11 
 
 
482 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.789625 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22418  catalase  44.44 
 
 
566 aa  386  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0265  catalase  43.13 
 
 
474 aa  386  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>