106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4660 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  92 
 
 
200 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  75.24 
 
 
211 aa  322  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  67.96 
 
 
210 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  71.71 
 
 
210 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  70.53 
 
 
210 aa  266  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  66.99 
 
 
210 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  68.45 
 
 
210 aa  260  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  68.45 
 
 
210 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  62.81 
 
 
199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  66.84 
 
 
199 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  43 
 
 
207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  46.63 
 
 
221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  50 
 
 
207 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  44.33 
 
 
221 aa  151  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  44.12 
 
 
221 aa  151  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  45.81 
 
 
221 aa  141  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  36.98 
 
 
223 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  40.39 
 
 
259 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  37.91 
 
 
214 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  34.55 
 
 
242 aa  128  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  34.55 
 
 
238 aa  128  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  38.02 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  37.98 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  39.81 
 
 
210 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  33.87 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  39.53 
 
 
245 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  31.18 
 
 
209 aa  104  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  30.77 
 
 
242 aa  104  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  30.37 
 
 
206 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  30.69 
 
 
212 aa  101  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  28.35 
 
 
209 aa  98.6  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  34.36 
 
 
231 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  35.68 
 
 
231 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  38.92 
 
 
233 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  29.57 
 
 
213 aa  89.4  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  37.57 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  30.39 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  30.48 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  29.8 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  26.56 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  31.63 
 
 
209 aa  85.5  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  30.95 
 
 
214 aa  85.5  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  32.38 
 
 
215 aa  84.7  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  30.89 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  38.31 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  34.76 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  27.62 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  34.93 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  26.32 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  26.07 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  29.1 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  31.44 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  37.06 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  37.06 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  37.06 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  37.06 
 
 
249 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  37.06 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  37.06 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  37.06 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  27.49 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  39.04 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  32.9 
 
 
218 aa  72  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  27.54 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  32.88 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  25.26 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  30.48 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  30.48 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  30.48 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  30 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  25.79 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  25.79 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  25.79 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  28.28 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  28.28 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  28.28 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  25.23 
 
 
303 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  31.21 
 
 
210 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  31.47 
 
 
221 aa  62  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  23.88 
 
 
319 aa  61.6  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  31.41 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  27.93 
 
 
305 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  28.42 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  29.47 
 
 
217 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  25 
 
 
336 aa  55.1  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  29.08 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  22.84 
 
 
328 aa  52.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  23.68 
 
 
214 aa  52.8  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2405  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  32.69 
 
 
206 aa  52.4  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  30.93 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  31.28 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1656  DSBA oxidoreductase  19.51 
 
 
231 aa  48.9  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000319257  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  23.03 
 
 
297 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  25.76 
 
 
217 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  25.93 
 
 
213 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3785  DSBA oxidoreductase  24.23 
 
 
210 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400426  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>