173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3110 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3110  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  387  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00654762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36350  hypothetical protein  93.48 
 
 
184 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0193577  normal  0.867285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2629  peptidase S14 ClpP  79.01 
 
 
183 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.358481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3267  Clp protease, putative  78.45 
 
 
198 aa  308  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2493  peptidase S14, ClpP  77.9 
 
 
183 aa  307  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2643  peptidase S14 ClpP  79.01 
 
 
183 aa  303  7e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00556113  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2263  peptidase S14, ClpP  65.93 
 
 
183 aa  255  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168754  normal  0.0339851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02290  clp protease  68.31 
 
 
142 aa  211  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25250  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  32.48 
 
 
212 aa  60.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0560465  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28390  protease subunit of ATP-dependent protease  32.81 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.10817 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1568  Endopeptidase Clp  30.86 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463332  normal  0.0340848 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0787  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.89 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1531  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  29.89 
 
 
208 aa  59.3  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.307133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3078  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.91 
 
 
205 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6060  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.74 
 
 
203 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353257  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2052  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.27 
 
 
201 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.913784  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  34.19 
 
 
211 aa  54.3  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86088  mitochondrial Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  26.7 
 
 
232 aa  53.9  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0480  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.98 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2790  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.55 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1448  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.83 
 
 
210 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0110  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  31.25 
 
 
201 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.229067 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01350  conserved hypothetical protein  29.38 
 
 
260 aa  52  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00166627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  31.16 
 
 
200 aa  52  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1734  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.68 
 
 
201 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.132166  normal  0.350369 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0917  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.07 
 
 
211 aa  52  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4258  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.32 
 
 
240 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621412  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0197  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.62 
 
 
210 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389971  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1830  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.62 
 
 
210 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1183  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  29.93 
 
 
199 aa  51.2  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.179836  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0511  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  30.61 
 
 
197 aa  50.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.1021  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4919  endopeptidase Clp  30.82 
 
 
236 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438524  hitchhiker  0.00520198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1479  Endopeptidase Clp  28.47 
 
 
195 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92711  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2913  Endopeptidase Clp  28.74 
 
 
215 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2151  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.69 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1338  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  33.66 
 
 
211 aa  49.3  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.114529  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  21.68 
 
 
210 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0218  Endopeptidase Clp  28.08 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2588  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.77 
 
 
218 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0199  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  28.41 
 
 
198 aa  48.9  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1978  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.72 
 
 
197 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0100238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1873  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.57 
 
 
199 aa  48.9  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0161226  normal  0.0102896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3578  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.52 
 
 
195 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3651  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.52 
 
 
195 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.52 
 
 
195 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.117643  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3435  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  28.28 
 
 
203 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3353  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  28.28 
 
 
203 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3499  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  28.28 
 
 
203 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1718  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  29.93 
 
 
209 aa  48.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.866088  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4040  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.52 
 
 
194 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3232  endopeptidase Clp  26.09 
 
 
213 aa  48.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124427  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5224  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.57 
 
 
217 aa  47.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.688333 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2808  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  31.68 
 
 
208 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0596044  normal  0.977221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4515  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  29.28 
 
 
202 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010245  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09663  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  26.8 
 
 
182 aa  47.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.409617  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1928  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  27.21 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000803868  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3324  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.09 
 
 
212 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.09384 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1915  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.41 
 
 
199 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180231  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  21.68 
 
 
203 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0202  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.34 
 
 
200 aa  47  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.211478  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1906  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.9 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36552  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.9 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.692844  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2229  endopeptidase Clp  25.99 
 
 
211 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1527  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.01 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.73019  normal  0.314697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  26.81 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5134  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.41 
 
 
208 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1696  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.89 
 
 
210 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2407  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  28.74 
 
 
252 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428709  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1792  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.5 
 
 
199 aa  45.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0851453  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  26.44 
 
 
216 aa  45.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.476881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12486  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.85 
 
 
200 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1841  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28 
 
 
217 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.714013  normal  0.0188426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7405  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.33 
 
 
209 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0357539  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6156  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28 
 
 
217 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1911  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28 
 
 
217 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.467927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1923  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28 
 
 
217 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.349475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1011  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.75 
 
 
219 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258522  normal  0.818355 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1946  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28 
 
 
217 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.33 
 
 
208 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0691  Endopeptidase Clp  30.22 
 
 
202 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.238496  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2565  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28 
 
 
212 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6327  Endopeptidase Clp  25 
 
 
202 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1440  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.57 
 
 
218 aa  45.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.53484  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1537  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  28.74 
 
 
200 aa  45.1  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1265  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  25.86 
 
 
209 aa  45.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5374  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  26.79 
 
 
193 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3401  Endopeptidase Clp  25.17 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.308742 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4985  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  26.29 
 
 
207 aa  45.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935151  normal  0.656558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1349  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28 
 
 
217 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131844  normal  0.0275798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2371  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.33 
 
 
208 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271973  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2416  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.33 
 
 
208 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12180  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  28.48 
 
 
197 aa  45.1  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2679  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.33 
 
 
208 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28 
 
 
216 aa  44.7  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415428  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1272  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  30.61 
 
 
199 aa  44.7  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3011  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.08 
 
 
199 aa  44.7  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2544  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  27.84 
 
 
202 aa  44.7  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00389922 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  26.76 
 
 
221 aa  44.7  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.753461  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1292  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  27.84 
 
 
202 aa  44.7  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0505091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3591  endopeptidase Clp  25.71 
 
 
211 aa  44.7  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00212365  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>