21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2633 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2633  EF hand domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  293  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202488  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3148  hypothetical protein  32.37 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3064  hypothetical protein  31.9 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  28.95 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  28.79 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3284  signal transduction protein  30.77 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0725465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2235  calcium-binding domain-containing protein  30.16 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.538566  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03592  EF hand domain protein  31.58 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.306427  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3604  signal transduction protein  28.18 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0412957  hitchhiker  0.00158231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  29.36 
 
 		 218 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0488  calcium-binding EF-hand  27.14 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0133587  normal  0.146102 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  28.44 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1805  putative signal transduction protein with EFhand domain  30.77 
 
 		 133 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.537311 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45986  predicted protein  28.95 
 
 		 149 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3184  calcium-binding EF-hand-containing protein  25 
 
 		 225 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53519  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2341  signal transduction protein  30.4 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2120  putative signal transduction protein with EFhand domain  45.1 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1854  hypothetical protein  29.81 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2189  putative signal transduction protein with EFhand domain  29.81 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350959  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.75 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  26.81 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>