More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0121 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0121  oxidoreductase FAD-binding region  100 
 
 
248 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0109  oxidoreductase FAD-binding region  79.63 
 
 
216 aa  335  3.9999999999999995e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5181  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  48.54 
 
 
234 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350006  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2080  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.53 
 
 
239 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.7178  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0922  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.7 
 
 
247 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2125  oxidoreductase FAD-binding subunit  46.03 
 
 
243 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.122233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2402  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  46.03 
 
 
243 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.560839  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4471  oxidoreductase FAD-binding subunit  48.96 
 
 
233 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3398  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.26 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1054  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.76 
 
 
248 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.543826  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3726  oxidoreductase FAD-binding region  40.83 
 
 
243 aa  171  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5577  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.82 
 
 
261 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6290  oxidoreductase FAD-binding region  41.18 
 
 
250 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2269  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.91 
 
 
252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4092  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.87 
 
 
269 aa  158  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.93 
 
 
255 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0605  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.4 
 
 
242 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3261  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.32 
 
 
244 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1056  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.13 
 
 
264 aa  139  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0935  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.75 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2611  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.36 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124004  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0231  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.04 
 
 
168 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.202422  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  30.23 
 
 
368 aa  99.4  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.99 
 
 
356 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.26 
 
 
752 aa  93.2  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31.45 
 
 
675 aa  91.3  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.33 
 
 
363 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.8 
 
 
681 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.31 
 
 
396 aa  89.4  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.03 
 
 
382 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  28.03 
 
 
382 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.03 
 
 
382 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1656  ferredoxin/oxidoreductase, FAD/NAD-binding  30.1 
 
 
342 aa  88.6  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1354  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.1 
 
 
360 aa  88.6  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.45 
 
 
380 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  28.45 
 
 
381 aa  88.6  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.62 
 
 
382 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.71 
 
 
375 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.66 
 
 
381 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.45 
 
 
380 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  28.15 
 
 
373 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.22 
 
 
414 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  28.03 
 
 
382 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.62 
 
 
382 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.62 
 
 
382 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.03 
 
 
380 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.03 
 
 
381 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.03 
 
 
380 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.51 
 
 
367 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  28.03 
 
 
380 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  26.56 
 
 
585 aa  86.3  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  32.76 
 
 
379 aa  86.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.74 
 
 
669 aa  85.5  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  28.85 
 
 
366 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  28.85 
 
 
366 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.62 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  29 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0410  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.45 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  31.65 
 
 
597 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.09 
 
 
375 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0575  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.23 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  31.03 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  27.84 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  27.88 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  31.11 
 
 
418 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.37 
 
 
677 aa  83.2  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  26.94 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  33.04 
 
 
606 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  33.04 
 
 
606 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3792  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.4 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000109386  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.24 
 
 
368 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.4 
 
 
390 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  32.14 
 
 
625 aa  82  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.07 
 
 
351 aa  82  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  27.16 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3715  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.67 
 
 
467 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437326  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.51 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.84 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  28.09 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4465  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.74 
 
 
699 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30710  Multi-component phenol hydoxylase, reductase subunit; LapP  29.24 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431626  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.51 
 
 
702 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.84 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.54 
 
 
687 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.09 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.93 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0992  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.57 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0107588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3690  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.25 
 
 
468 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.7 
 
 
585 aa  79.3  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.2 
 
 
375 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.91 
 
 
676 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  26.69 
 
 
394 aa  78.6  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2489  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.06 
 
 
328 aa  78.6  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  25.71 
 
 
403 aa  78.6  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.2 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2508  oxygenase, putative  28.02 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.663767  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1267  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.31 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1052  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.14 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.705726  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1068  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.25 
 
 
384 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.570837  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  29.11 
 
 
627 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>