69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3572 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3572  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2202  hypothetical protein  99.56 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.808249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2349  hypothetical protein  96.89 
 
 		 225 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2959  hypothetical protein  94.22 
 
 		 225 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00977193  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7081  hypothetical protein  82.22 
 
 		 225 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0655705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5673  hypothetical protein  85.33 
 
 		 225 aa  360  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396491  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6993  hypothetical protein  84.89 
 
 		 225 aa  360  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.869328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6422  hypothetical protein  84.44 
 
 		 225 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.99012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2366  protein of unknown function DUF1028  79.11 
 
 		 225 aa  353  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3464  hypothetical protein  80.44 
 
 		 225 aa  342  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616711 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6044  hypothetical protein  79.11 
 
 		 225 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00596745  hitchhiker  0.000198605 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5406  hypothetical protein  80 
 
 		 225 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0245954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71190  hypothetical protein  77.33 
 
 		 224 aa  322  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6177  hypothetical protein  77.33 
 
 		 224 aa  322  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3268  hypothetical protein  66.67 
 
 		 225 aa  308  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal  0.0348053 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3032  hypothetical protein  69.03 
 
 		 225 aa  287  7e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00540438  normal  0.842366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0444  hypothetical protein  60.44 
 
 		 224 aa  269  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2387  hypothetical protein  52 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3455  hypothetical protein  51.11 
 
 		 224 aa  204  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3226  hypothetical protein  53.54 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2045  hypothetical protein  49.56 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1856  hypothetical protein  44.69 
 
 		 239 aa  174  9e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0064  protein of unknown function DUF1028  42.86 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0379  protein of unknown function DUF1028  45.89 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2581  hypothetical protein  47.5 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1662  protein of unknown function DUF1028  50.67 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.444376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0704  protein of unknown function DUF1028  39.71 
 
 		 287 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2428  protein of unknown function DUF1028  37.62 
 
 		 297 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4339  protein of unknown function DUF1028  40.45 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0396233  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4426  hypothetical protein  40.1 
 
 		 310 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0871  hypothetical protein  40.3 
 
 		 288 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2851  hypothetical protein  36.04 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0160  hypothetical protein  39.89 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1006  hypothetical protein  39.89 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.728263 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2258  hypothetical protein  38.95 
 
 		 224 aa  105  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1405  hypothetical protein  39.11 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0971  protein of unknown function DUF1028  32.68 
 
 		 297 aa  99.8  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0491555  normal  0.0527085 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0928  protein of unknown function DUF1028  36.02 
 
 		 292 aa  99.4  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2646  protein of unknown function DUF1028  38.54 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.475903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0329  protein of unknown function DUF1028  39.57 
 
 		 327 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0976  hypothetical protein  35.41 
 
 		 270 aa  96.3  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0314029 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2631  hypothetical protein  37.7 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4048  protein of unknown function DUF1028  38.35 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3098  hypothetical protein  40.29 
 
 		 285 aa  95.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0318  protein of unknown function DUF1028  39.04 
 
 		 327 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194212  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0130  protein of unknown function DUF1028  36.36 
 
 		 353 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4107  protein of unknown function DUF1028  34.72 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3267  hypothetical protein  36.5 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0307  hypothetical protein  38.5 
 
 		 327 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1609  hypothetical protein  33.65 
 
 		 289 aa  88.2  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.457391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0217  protein of unknown function DUF1028  37.81 
 
 		 324 aa  85.5  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974495 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0619  protein of unknown function DUF1028  33.04 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.265478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2646  hypothetical protein  36.19 
 
 		 296 aa  78.6  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1145  hypothetical protein  36.04 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1274  protein of unknown function DUF1028  36.23 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1205  protein of unknown function DUF1028  36.23 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377065  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0033  protein of unknown function DUF1028  34.22 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0234991 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01761  hypothetical protein  28.26 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5619  protein of unknown function DUF1028  33.63 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1192  hypothetical protein  37.04 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0590  protein of unknown function DUF1028  30.77 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0883139  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16540  hypothetical protein  36.88 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1479  protein of unknown function DUF1028  28.16 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3117  hypothetical protein  31.73 
 
 		 292 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04410  hypothetical protein  35.42 
 
 		 293 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2687  hypothetical protein  36.87 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2917  hypothetical protein  31.1 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3100  hypothetical protein  37.59 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3041  protein of unknown function DUF1028  28.57 
 
 		 257 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>