50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1336 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1336  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.296421  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4245  GHMP kinase  30.47 
 
 
328 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.469148 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0147  GHMP kinase  30.34 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  28.16 
 
 
333 aa  116  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0206  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase, putative  30 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0788  GHMP kinase  30.15 
 
 
328 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1227  GHMP kinase  28.42 
 
 
333 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464209  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3977  GHMP kinase  34.93 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5465  GHMP kinase  26.05 
 
 
326 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0793  GHMP kinase  26.32 
 
 
331 aa  94  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5597  GHMP kinase  27.38 
 
 
326 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1635  GHMP kinase  22.3 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1662  GHMP kinase  22.3 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501068  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0153  GHMP kinase  26.64 
 
 
347 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0447  GHMP kinase  25.45 
 
 
347 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4217  GHMP kinase  25.27 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3600  GHMP kinase  27.17 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  27.05 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4922  GHMP kinase  24.25 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272679  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0720  GHMP kinase  23.66 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1374  GHMP kinase  23.89 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3581  GHMP kinase  22.95 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1742  GHMP kinase  22.14 
 
 
343 aa  63.5  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  40.74 
 
 
382 aa  63.2  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2296  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  27.53 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  20.51 
 
 
350 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3292  WcbL  27.53 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0532  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  27.53 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22033  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2174  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  27.53 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3278  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  27.53 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3243  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  27.53 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1068  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  27.53 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  22.03 
 
 
339 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  38.16 
 
 
361 aa  60.5  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  23.32 
 
 
339 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  28.72 
 
 
380 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  24.45 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2431  GHMP kinase  24.8 
 
 
343 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696498  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  23.55 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  26.32 
 
 
343 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10116  D-alpha-D-heptose-7-phosphate kinase hddA  23.97 
 
 
386 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0952  GHMP kinase  26.35 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70731  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2647  GHMP kinase  22.35 
 
 
293 aa  46.2  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  34.48 
 
 
403 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  24.79 
 
 
387 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  33.01 
 
 
301 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  28.07 
 
 
316 aa  43.9  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0831  GHMP kinase  26.92 
 
 
289 aa  43.1  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.680732  normal  0.0934854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  20.14 
 
 
414 aa  42.7  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  31.17 
 
 
355 aa  42.4  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>