More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89371 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_89371  predicted protein  100 
 
 		 137 aa  274  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03100  60s ribosomal protein l23, putative  82.84 
 
 		 138 aa  234  2e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04494  hypothetical protein similar to AGL288Wp (Broad)  80.74 
 
 		 140 aa  231  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0435617 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18267  Ribosomal protein L23, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  70.37 
 
 		 140 aa  202  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0410361  normal  0.0407841 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50259  predicted protein  68.94 
 
 		 143 aa  196  6e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.254576  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1511  50S ribosomal protein L14P  51.59 
 
 		 135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.30331e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0654  50S ribosomal protein L14P  50.41 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000102668  decreased coverage  0.0000588406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1264  50S ribosomal protein L14P  51.24 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0169  50S ribosomal protein L14P  51.24 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000775271  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0720  50S ribosomal protein L14P  50.41 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00745275  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1394  50S ribosomal protein L14P  55.86 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1718  50S ribosomal protein L14P  46.92 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0800  50S ribosomal protein L14b/L23e  47.45 
 
 		 140 aa  124  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.276412 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1768  50S ribosomal protein L14P  45.38 
 
 		 138 aa  124  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0483  50S ribosomal protein L14P  45.26 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186815  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1838  50S ribosomal protein L14P  44.53 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.890831 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0101  50S ribosomal protein L14P  47.86 
 
 		 138 aa  120  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000731136  unclonable  0.000000456679 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0011  50S ribosomal protein L14P  43.08 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000740699  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2439  50S ribosomal protein L14P  43.75 
 
 		 132 aa  115  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0513  50S ribosomal protein L14P  46.92 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0581321 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0220  50S ribosomal protein L14P  42.97 
 
 		 132 aa  115  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2228  50S ribosomal protein L14P  42.97 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1330  50S ribosomal protein L14P  43.85 
 
 		 144 aa  114  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.293938  normal  0.208543 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0100  50S ribosomal protein L14P  44.26 
 
 		 132 aa  114  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2302  50S ribosomal protein L14P  43.2 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1784  50S ribosomal protein L14P  46.92 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1596  50S ribosomal protein L14P  46.92 
 
 		 144 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1682  50S ribosomal protein L14P  46.15 
 
 		 144 aa  113  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.810973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0542  50S ribosomal protein L14P  43.44 
 
 		 132 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.699463  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0091  50S ribosomal protein L14P  39.34 
 
 		 132 aa  108  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.474455 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0452  50S ribosomal protein L14P  42.06 
 
 		 132 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2243  50S ribosomal protein L14P  43.44 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000537709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0574  50S ribosomal protein L14P  43.44 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0484  50S ribosomal protein L14  42.86 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0461  50S ribosomal protein L14  41.9 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117525  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_427  ribosomal protein L14  41.9 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1174  ribosomal protein L14  37.82 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00146372  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  40.95 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1275  ribosomal protein L14  41.9 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0725  ribosomal protein L14  37.17 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0242  50S ribosomal protein L14  40 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0239  50S ribosomal protein L14  40 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.858519 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  37.96 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  42.45 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3002  50S ribosomal protein L14  39.25 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.807584  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1302  50S ribosomal protein L14  39.05 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.704063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  42.16 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1236  50S ribosomal protein L14  38.05 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.438717  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3713  50S ribosomal protein L14  40 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2286  50S ribosomal protein L14  43.69 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000233129  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1157  50S ribosomal protein L14  40 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000242417  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4353  ribosomal protein L14  42.45 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000335969  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3985  ribosomal protein L14  40 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  38.89 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2145  50S ribosomal protein L14P  39.82 
 
 		 122 aa  73.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0311872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5777  ribosomal protein L14  41.51 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2222  50S ribosomal protein L14  39.05 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.83061 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  37.96 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1350  ribosomal protein L14  35.24 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1841  50S ribosomal protein L14  43.69 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0521679  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0690  50S ribosomal protein L14  36.54 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.114606  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1473  50S ribosomal protein L14  36.28 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120396  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  37.96 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0187  50S ribosomal protein L14  39.05 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.396504 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0191  50S ribosomal protein L14  42.72 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00380745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0121  50S ribosomal protein L14  40.95 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.666809  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0387  50S ribosomal protein L14  38.1 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2054  50S ribosomal protein L14  41.75 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000371952  normal  0.398869 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf432  50S ribosomal protein L14  36.54 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  38.1 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0701  50S ribosomal protein L14  37.74 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000715462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2569  50S ribosomal protein L14  37.14 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23700  LSU ribosomal protein L14P  39.05 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0331269  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1151  ribosomal protein L14  36.04 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000029859  hitchhiker  0.000136956 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0852  ribosomal protein L14  40.54 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0636  50S ribosomal protein L14  35.19 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143899  hitchhiker  0.0000000109372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0225  50S ribosomal protein L14  37.04 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000052608  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2609  50S ribosomal protein L14  37.38 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000018933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0963  50S ribosomal protein L14  40 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217231  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0404  50S ribosomal protein L14  36.44 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0379  50S ribosomal protein L14  36.44 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1076  50S ribosomal protein L14  37.5 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00057031  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  40.2 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2219  50S ribosomal protein L14  41.75 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065108  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  40.2 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  40.2 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0117  50S ribosomal protein L14  40.95 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0777  50S ribosomal protein L14  39.64 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0816328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0120  50S ribosomal protein L14  39.05 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000694706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0151  50S ribosomal protein L14  39.05 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0132  50S ribosomal protein L14  39.05 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.09851e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0120  50S ribosomal protein L14  39.05 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000304915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0116  50S ribosomal protein L14  39.05 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.32667e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0114  50S ribosomal protein L14  39.05 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0114  50S ribosomal protein L14  39.05 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000639835  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2636  50S ribosomal protein L14  36.19 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.499658  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0120  50S ribosomal protein L14  39.05 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3913  50S ribosomal protein L14  38.1 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5185  50S ribosomal protein L14  39.05 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000182859  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4305  50S ribosomal protein L14  38.1 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.59616  normal  0.0114507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>