50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30952 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_30952  predicted protein  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.434131  normal  0.284292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  26.9 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04500  hypothetical protein  26.52 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000303386  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03635  conserved hypothetical protein  22.34 
 
 		 353 aa  55.5  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  26.06 
 
 		 172 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  26.06 
 
 		 175 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  26.21 
 
 		 172 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  25.71 
 
 		 172 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  26.21 
 
 		 172 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  26.62 
 
 		 172 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  23.72 
 
 		 172 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  24.84 
 
 		 175 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  25.52 
 
 		 172 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  24.65 
 
 		 172 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  23.94 
 
 		 171 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  25.64 
 
 		 181 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  23.23 
 
 		 174 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  26.12 
 
 		 172 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  26.12 
 
 		 172 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2554  50S ribosomal protein L10  23.03 
 
 		 181 aa  49.3  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  26.43 
 
 		 173 aa  48.9  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  23.23 
 
 		 171 aa  48.5  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  24.18 
 
 		 172 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  25.95 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  22.22 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  25.95 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  23.94 
 
 		 172 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1038  50S ribosomal protein L10  22.22 
 
 		 183 aa  47  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  25.55 
 
 		 172 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  28.15 
 
 		 166 aa  46.2  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  22.82 
 
 		 172 aa  46.2  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  24.18 
 
 		 172 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  20.28 
 
 		 172 aa  45.4  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0234  ribosomal protein L10  29.63 
 
 		 164 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.675629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  26.49 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  26.95 
 
 		 176 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  24.68 
 
 		 172 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0357  50S ribosomal protein L10  24.56 
 
 		 178 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.395491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  25.66 
 
 		 174 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  26.85 
 
 		 170 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  25.75 
 
 		 181 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  22.88 
 
 		 172 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  20.13 
 
 		 174 aa  43.1  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  23.02 
 
 		 172 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  23.4 
 
 		 186 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  22.06 
 
 		 171 aa  42.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  22.73 
 
 		 183 aa  42.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  26.75 
 
 		 174 aa  42  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  29.71 
 
 		 197 aa  42  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  27.41 
 
 		 174 aa  42  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>