More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9989 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_9989  predicted protein  100 
 
 
620 aa  1273    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860977  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_1733  predicted protein  42.52 
 
 
583 aa  434  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0224275 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03176  ATP-dependent rRNA helicase spb4 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F4]  37.18 
 
 
638 aa  298  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.541811  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02690  ATP-dependent RNA helicase, putative  36.04 
 
 
748 aa  294  3e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62830  ATP dependent RNA helicase  32.28 
 
 
617 aa  279  1e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0490658 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25999  predicted protein  33.81 
 
 
485 aa  258  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81459  RNA-dependent helicase  35.5 
 
 
567 aa  256  6e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.3042 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01060  conserved hypothetical protein  34.41 
 
 
607 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0340674  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46259  predicted protein  35.07 
 
 
589 aa  246  8e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01949  ATP-dependent RNA helicase has1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBY1]  33.87 
 
 
609 aa  240  5.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.429941  normal  0.205998 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42318  predicted protein  32.71 
 
 
481 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.712949  normal  0.0619314 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51414  ATP-dependent RNA helicase DBP4 (Helicase CA4) (Helicase UF1)  34.01 
 
 
765 aa  229  1e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13235  fructose-bisphosphate aldolase  34.43 
 
 
627 aa  217  5.9999999999999996e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00390046  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00589  ATP-dependent RNA helicase dbp4 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFU1]  31.55 
 
 
812 aa  213  7.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.19 
 
 
584 aa  194  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3342  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.15 
 
 
607 aa  192  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000502308  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07420  hypothetical protein  29.71 
 
 
859 aa  190  5e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.592915  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14161  helicase_3  31.5 
 
 
540 aa  189  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  33.11 
 
 
656 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41606  predicted protein  31.54 
 
 
755 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.323573 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19237  predicted protein  31.54 
 
 
710 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554541  normal  0.150728 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2800  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.24 
 
 
505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.74 
 
 
482 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.19 
 
 
550 aa  182  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1686  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.85 
 
 
395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.941975  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30 
 
 
528 aa  181  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.66 
 
 
527 aa  181  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1816  DEAD/DEAH box helicase-like  32.58 
 
 
531 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.43 
 
 
557 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.43 
 
 
557 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.43 
 
 
557 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.66 
 
 
527 aa  180  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  32.87 
 
 
528 aa  180  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16073  predicted protein  31.55 
 
 
474 aa  180  7e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.09 
 
 
467 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.46 
 
 
405 aa  179  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2118  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.2 
 
 
506 aa  178  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000739492  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1688  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.18 
 
 
509 aa  178  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.279594  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.2 
 
 
506 aa  178  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000532471  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4470  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.9 
 
 
564 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.230893 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.67 
 
 
533 aa  177  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.83 
 
 
559 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.67 
 
 
498 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  29.86 
 
 
527 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2005  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.92 
 
 
589 aa  176  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343146 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.17 
 
 
474 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.5 
 
 
531 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3706  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.91 
 
 
594 aa  174  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10125  ATP-dependent RNA helicase (Drs1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14990)  34.49 
 
 
814 aa  174  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00305342  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1950  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.28 
 
 
522 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_28984  predicted protein  33.6 
 
 
433 aa  173  9e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.9 
 
 
565 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1643  superfamily II DNA/RNA helicase  33.02 
 
 
521 aa  172  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605464  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0146  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.42 
 
 
462 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.45 
 
 
423 aa  172  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.35 
 
 
466 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.25 
 
 
597 aa  172  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.04 
 
 
595 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0501  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.47 
 
 
451 aa  172  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17560  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.28 
 
 
731 aa  172  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0588083  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2820  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.41 
 
 
556 aa  172  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00179058  normal  0.0521879 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_1703  nucleolar DEAD-box protein required for synthesis of 60S ribosomal subunits  33.33 
 
 
672 aa  172  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1236  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.91 
 
 
408 aa  171  3e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.02 
 
 
623 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.36 
 
 
528 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  32.36 
 
 
528 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1305  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.9 
 
 
602 aa  171  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.36 
 
 
511 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.36 
 
 
528 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33 
 
 
599 aa  171  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  32.36 
 
 
528 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  32.36 
 
 
533 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2724  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.86 
 
 
462 aa  171  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.566366  normal  0.0215691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.58 
 
 
646 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.76 
 
 
640 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.36 
 
 
525 aa  171  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  32.36 
 
 
528 aa  171  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2294  hypothetical protein  31.5 
 
 
589 aa  171  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2267  hypothetical protein  31.5 
 
 
589 aa  171  4e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.76 
 
 
640 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.76 
 
 
640 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  32.36 
 
 
525 aa  171  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0603  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.82 
 
 
591 aa  171  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18210  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.67 
 
 
614 aa  171  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461192  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0299  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.36 
 
 
364 aa  171  5e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.76 
 
 
640 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.66 
 
 
546 aa  171  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.25 
 
 
623 aa  170  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1511  predicted protein  29.33 
 
 
560 aa  170  6e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.485737  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.2 
 
 
514 aa  170  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  32.36 
 
 
529 aa  170  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05623  conserved hypothetical protein  30.36 
 
 
567 aa  170  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0060242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.18 
 
 
538 aa  170  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.78 
 
 
747 aa  170  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33 
 
 
541 aa  170  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.42 
 
 
546 aa  170  8e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00583  ATP-dependent RNA helicase dbp10 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFU7]  33.85 
 
 
936 aa  169  9e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.16 
 
 
530 aa  170  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.76 
 
 
607 aa  169  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.017054  normal  0.720031 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  31.94 
 
 
589 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>