More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_8683 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_8683  predicted protein  100 
 
 		 164 aa  343  8e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437829  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14769  predicted protein  50 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13107  predicted protein  45.35 
 
 		 170 aa  137  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  44.23 
 
 		 220 aa  120  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  42.31 
 
 		 229 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0974  peptide methionine sulfoxide reductase  40.59 
 
 		 214 aa  117  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2540  peptide methionine sulfoxide reductase  42.31 
 
 		 220 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  42.95 
 
 		 225 aa  114  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2198  methionine sulfoxide reductase A  41.29 
 
 		 217 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4697  methionine sulfoxide reductase A  40.13 
 
 		 212 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1335  peptide methionine sulfoxide reductase  43.23 
 
 		 216 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.907867  normal  0.30291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0458  methionine sulfoxide reductase A  42.04 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.494064  normal  0.107484 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04090  methionine sulfoxide reductase A  39.49 
 
 		 212 aa  111  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3773  peptide methionine sulfoxide reductase  39.49 
 
 		 212 aa  111  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.978069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4789  methionine sulfoxide reductase A  39.49 
 
 		 212 aa  111  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5736  methionine sulfoxide reductase A  39.49 
 
 		 212 aa  111  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4863  methionine sulfoxide reductase A  39.49 
 
 		 212 aa  111  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04053  hypothetical protein  39.49 
 
 		 212 aa  111  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4473  methionine sulfoxide reductase A  39.49 
 
 		 212 aa  111  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3788  methionine sulfoxide reductase A  39.49 
 
 		 212 aa  111  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4995  methionine sulfoxide reductase A  41.94 
 
 		 220 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  40.25 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2260  methionine sulfoxide reductase A  40.65 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0350484 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4402  peptide methionine sulfoxide reductase  43.87 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4676  methionine sulfoxide reductase A  40.13 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1892  peptide methionine sulfoxide reductase  42.95 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4772  methionine sulfoxide reductase A  39.49 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0559  peptide methionine sulfoxide reductase  43.23 
 
 		 224 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48494  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2211  peptide methionine sulfoxide reductase  42.58 
 
 		 224 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63317  normal  0.954559 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1937  peptide methionine sulfoxide reductase  38.69 
 
 		 246 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3576  methionine sulfoxide reductase A  41.67 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  40.38 
 
 		 212 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1180  methionine sulfoxide reductase A  40.65 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4827  methionine sulfoxide reductase A  38.85 
 
 		 212 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.135002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4687  methionine sulfoxide reductase A  38.85 
 
 		 212 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4806  methionine sulfoxide reductase A  38.85 
 
 		 212 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0397  methionine sulfoxide reductase A  39.49 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2156  peptide methionine sulfoxide reductase  41.29 
 
 		 218 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  40.38 
 
 		 220 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3626  methionine sulfoxide reductase A  40.76 
 
 		 212 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1987  peptide methionine sulfoxide reductase  41.67 
 
 		 213 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0396207  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  43.03 
 
 		 181 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1862  protein-methionine-S-oxide reductase  41.72 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  37.91 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2072  peptide methionine sulfoxide reductase  40.38 
 
 		 213 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  40.51 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3771  methionine sulfoxide reductase A  40.76 
 
 		 212 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3961  methionine sulfoxide reductase A  40.76 
 
 		 212 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  40.76 
 
 		 155 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4419  methionine sulfoxide reductase A  40.46 
 
 		 215 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2259  peptide methionine sulfoxide reductase  34.67 
 
 		 177 aa  104  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00118582  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0787  methionine sulfoxide reductase A  40.13 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4424  peptide methionine sulfoxide reductase  39.1 
 
 		 223 aa  104  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00185603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3312  peptide methionine sulfoxide reductase  38.71 
 
 		 219 aa  104  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  40.91 
 
 		 221 aa  104  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2080  methionine sulfoxide reductase A  36.26 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39501  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1148  peptide methionine sulfoxide reductase  38.73 
 
 		 237 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2494  peptide methionine sulfoxide reductase  41.03 
 
 		 218 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  38.22 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0364  methionine sulfoxide reductase A  40.51 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0336  methionine sulfoxide reductase A  40.65 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.337081 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  39.87 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  42.14 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0361  methionine sulfoxide reductase A  40.65 
 
 		 240 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18473  normal  0.721253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1898  peptide methionine sulfoxide reductase  40.26 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0459  methionine sulfoxide reductase A  40.65 
 
 		 221 aa  100  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  40.37 
 
 		 212 aa  100  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  40.99 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0405  peptide methionine sulfoxide reductase  39.24 
 
 		 215 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4867  methionine sulfoxide reductase A  39.35 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974418  normal  0.443153 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  39.74 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  37.01 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  37.82 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1107  peptide methionine sulfoxide reductase  35.48 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.704075  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3157  peptide methionine sulfoxide reductase  36.63 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0835  peptide methionine sulfoxide reductase  42.21 
 
 		 221 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  39.61 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4738  peptide methionine sulfoxide reductase  38.46 
 
 		 216 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  39.24 
 
 		 222 aa  98.2  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  42.68 
 
 		 162 aa  98.6  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.91 
 
 		 334 aa  98.2  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3294  peptide methionine sulfoxide reductase  39.87 
 
 		 216 aa  97.8  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2572  peptide methionine sulfoxide reductase  39.07 
 
 		 223 aa  97.8  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  37.66 
 
 		 208 aa  98.2  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  40.91 
 
 		 211 aa  97.8  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  38.85 
 
 		 180 aa  97.8  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4771  methionine sulfoxide reductase A  39.87 
 
 		 215 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5071  peptide methionine sulfoxide reductase  40.13 
 
 		 220 aa  97.4  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44940  Peptide methionine sulfoxide reductase  38.96 
 
 		 216 aa  97.4  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2979  peptide methionine sulfoxide reductase  40.4 
 
 		 222 aa  96.7  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  39.22 
 
 		 214 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0572  peptide methionine sulfoxide reductase  37.91 
 
 		 219 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192366 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  37.01 
 
 		 287 aa  96.7  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3895  peptide methionine sulfoxide reductase  39.61 
 
 		 233 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3981  methionine sulfoxide reductase A  38.46 
 
 		 219 aa  97.1  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5321  methionine sulfoxide reductase A  36.21 
 
 		 218 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1311  methionine sulfoxide reductase A  38.1 
 
 		 237 aa  96.3  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.518036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  37.42 
 
 		 320 aa  95.9  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0621  peptide methionine sulfoxide reductase  37.25 
 
 		 194 aa  95.9  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  39.24 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>