More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_32326 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_32326  predicted protein  100 
 
 
309 aa  627  1e-179  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.77 
 
 
332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.07 
 
 
315 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.07 
 
 
315 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0692  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.07 
 
 
315 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3550  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.07 
 
 
315 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0719  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.75 
 
 
315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196966  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3463  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.07 
 
 
315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.281933  normal  0.770216 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3130  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.07 
 
 
324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268526  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.95 
 
 
315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015709  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.62 
 
 
314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3837  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.75 
 
 
315 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0797  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.75 
 
 
315 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97766  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.62 
 
 
311 aa  301  6.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3173  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.75 
 
 
315 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.283101  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0793  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.75 
 
 
315 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000256168  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0765  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.75 
 
 
315 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.675099  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0172  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.62 
 
 
315 aa  301  9e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093989 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3689  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
324 aa  301  9e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00564575  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.62 
 
 
314 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.07 
 
 
324 aa  300  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000010971  normal  0.440092 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.43 
 
 
315 aa  300  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.75 
 
 
315 aa  299  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.81 
 
 
318 aa  298  6e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.613331  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  53.27 
 
 
312 aa  298  8e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.61 
 
 
315 aa  298  9e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.9 
 
 
322 aa  297  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.47 
 
 
311 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.95 
 
 
313 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.31 
 
 
322 aa  296  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2365  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.13 
 
 
316 aa  295  9e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2464  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.13 
 
 
315 aa  294  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.162098  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2070  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.13 
 
 
315 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000481775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2184  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.13 
 
 
315 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.12 
 
 
314 aa  294  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1986  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.81 
 
 
315 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.675824  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.3 
 
 
325 aa  292  4e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1852  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.49 
 
 
315 aa  292  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.220471  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.05 
 
 
309 aa  292  4e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.05 
 
 
315 aa  291  8e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
312 aa  291  8e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2411  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.49 
 
 
315 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.49 
 
 
315 aa  290  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.93 
 
 
311 aa  290  2e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.39 
 
 
317 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.39 
 
 
317 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.39 
 
 
317 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.39 
 
 
317 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.39 
 
 
317 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.39 
 
 
317 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2118  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
315 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.092676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.39 
 
 
317 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.39 
 
 
317 aa  290  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.39 
 
 
317 aa  290  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.39 
 
 
317 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.65 
 
 
315 aa  289  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127042  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.81 
 
 
315 aa  289  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
323 aa  289  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2567  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.81 
 
 
315 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.73 
 
 
315 aa  288  6e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01182  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.65 
 
 
315 aa  288  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472694  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1355  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.65 
 
 
315 aa  288  7e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000522341  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1913  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.49 
 
 
315 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  0.8749 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.49 
 
 
315 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049338  normal  0.157535 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1312  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.65 
 
 
315 aa  288  7e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01192  hypothetical protein  50.65 
 
 
315 aa  288  7e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.332422  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1977  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.49 
 
 
315 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607656  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2419  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.65 
 
 
315 aa  288  7e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0172206  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1919  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.49 
 
 
315 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.167319  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1357  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.49 
 
 
315 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000430302  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1688  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.65 
 
 
315 aa  288  7e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000327484  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.02 
 
 
309 aa  288  7e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2440  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.65 
 
 
337 aa  288  9e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.019928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1935  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.65 
 
 
337 aa  288  9e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351672  normal  0.350342 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.06 
 
 
317 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  49.19 
 
 
321 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.39 
 
 
309 aa  287  2e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.05 
 
 
329 aa  287  2e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.77 
 
 
308 aa  286  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
320 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  49.19 
 
 
313 aa  286  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.48 
 
 
319 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.3 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2105  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.49 
 
 
318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537624  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.16 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.613362  normal  0.368621 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.35 
 
 
312 aa  286  4e-76  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.855019  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  49.03 
 
 
317 aa  286  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.49 
 
 
312 aa  285  5e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000644395 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0283  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
318 aa  285  5e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.51 
 
 
314 aa  285  5.999999999999999e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.19 
 
 
313 aa  285  8e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.19 
 
 
316 aa  285  9e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.19 
 
 
324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1104  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.7 
 
 
313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.51 
 
 
316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.84 
 
 
319 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.81 
 
 
316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.81 
 
 
316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>