More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1396 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1396  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 339 aa  686    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0333198 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0808  rod shape-determining protein MreB  65.29 
 
 		 340 aa  441  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0194  rod shape-determining protein MreB  60.88 
 
 		 340 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5925  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  58.7 
 
 		 341 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0249  rod shape-determining protein MreB  57.86 
 
 		 343 aa  404  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3308  rod shape-determining protein MreB  59.41 
 
 		 342 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0785141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3832  rod shape-determining protein MreB  57.44 
 
 		 341 aa  395  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.11388 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00565  putative rod-shape determining protein  57.27 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.444637  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1407  rod shape-determining protein MreB  55.59 
 
 		 342 aa  389  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.321094  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1458  rod shape-determining protein MreB  56.33 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.54 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1290  rod shape-determining protein MreB  49.4 
 
 		 342 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69839  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0553  rod shape-determining protein MreB  50.6 
 
 		 345 aa  312  5.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.212626 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0512  rod shape-determining protein MreB  50.45 
 
 		 342 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.370229  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0800  rod shape-determining protein MreB  50.45 
 
 		 342 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0691  rod shape-determining protein MreB  48.51 
 
 		 342 aa  308  5.9999999999999995e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.444485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0848  rod shape-determining protein MreB  49.26 
 
 		 351 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000008182  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1820  rod shape-determining protein MreB  48.81 
 
 		 342 aa  305  7e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  47.01 
 
 		 346 aa  302  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  49.24 
 
 		 342 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  47.6 
 
 		 345 aa  299  4e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  46.61 
 
 		 343 aa  296  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  47.8 
 
 		 346 aa  295  8e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  48.22 
 
 		 347 aa  293  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1465  rod shape-determining protein MreB  46.8 
 
 		 345 aa  294  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  49.11 
 
 		 344 aa  293  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  46.36 
 
 		 342 aa  293  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  47.48 
 
 		 343 aa  294  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  47.45 
 
 		 347 aa  293  3e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  47.45 
 
 		 347 aa  293  3e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  46.06 
 
 		 342 aa  292  7e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  47.32 
 
 		 348 aa  291  9e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  47.37 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000550029  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  49.69 
 
 		 348 aa  291  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  45.59 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  46.04 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  48.66 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  45.83 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  46.92 
 
 		 343 aa  289  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18141  rod shape-determining protein MreB  47.95 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.208246  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1630  rod shape-determining protein MreB  45.53 
 
 		 348 aa  288  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0107268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  46.59 
 
 		 348 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1715  rod shape-determining protein MreB  47.95 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  46.29 
 
 		 345 aa  288  1e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  45.56 
 
 		 346 aa  287  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18321  rod shape-determining protein MreB  47.95 
 
 		 350 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  46.53 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18111  rod shape-determining protein MreB  47.95 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.165952  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  45.7 
 
 		 354 aa  286  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1235  rod shape-determining protein MreB  46.18 
 
 		 329 aa  286  4e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  45.27 
 
 		 346 aa  286  5e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  45.27 
 
 		 346 aa  286  5e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  47.18 
 
 		 345 aa  285  7e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  46.53 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1352  rod shape-determining protein MreB  46.43 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.261173  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  47.37 
 
 		 358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1150  rod shape-determining protein MreB  46.65 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564796 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0317  rod shape-determining protein MreB  45.27 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.594365  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1199  rod shape-determining protein MreB  47.21 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  46.65 
 
 		 347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20741  rod shape-determining protein MreB  47.21 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.637014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  46.13 
 
 		 343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1917  rod shape-determining protein MreB  45.02 
 
 		 340 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.695972  hitchhiker  0.000105138 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17481  rod shape-determining protein MreB  47.48 
 
 		 360 aa  281  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0082  rod shape-determining protein MreB  47.13 
 
 		 366 aa  281  9e-75  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2125  rod shape-determining protein MreB  44.94 
 
 		 345 aa  281  9e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.55936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  43.41 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0061  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  45.32 
 
 		 337 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  44.87 
 
 		 350 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  46.71 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  47.04 
 
 		 358 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  46.36 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4170  rod shape-determining protein MreB  49.24 
 
 		 349 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000201977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  46.85 
 
 		 344 aa  280  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  45.67 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0348  rod shape-determining protein MreB  45.95 
 
 		 336 aa  280  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0865019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  43.82 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  43.82 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  43.82 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  43.82 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0330  rod shape-determining protein MreB  45.95 
 
 		 336 aa  280  3e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000934452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  43.82 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  43.82 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  47.02 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  48.5 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  43.82 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  44.05 
 
 		 338 aa  279  4e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1122  rod shape-determining protein MreB  45.72 
 
 		 347 aa  279  4e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  43.82 
 
 		 339 aa  279  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0573  rod shape-determining protein MreB  47.04 
 
 		 335 aa  279  5e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.788232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  43.82 
 
 		 339 aa  279  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0866  MreB/Mrl family cell shape determining protein  46.83 
 
 		 335 aa  279  5e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  46.88 
 
 		 359 aa  279  6e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  43.82 
 
 		 339 aa  278  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  45.07 
 
 		 340 aa  278  7e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  44.18 
 
 		 344 aa  278  8e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0739  rod shape-determining protein MreB  46.88 
 
 		 349 aa  278  8e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.766157  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0868  rod shape-determining protein MreB  44.35 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  46.93 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>