22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0871 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0871  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  951    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0242601 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1624  hypothetical protein  34.93 
 
 		 458 aa  253  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03960  hypothetical protein  25.61 
 
 		 422 aa  189  9e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.23056  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.94 
 
 		 866 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  23.12 
 
 		 813 aa  80.1  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0243  hypothetical protein  21.04 
 
 		 509 aa  74.7  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  21.36 
 
 		 815 aa  74.3  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  23.72 
 
 		 848 aa  73.2  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2603  hypothetical protein  24.89 
 
 		 517 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1359  hypothetical protein  22.61 
 
 		 542 aa  65.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2834  hypothetical protein  22.3 
 
 		 520 aa  64.7  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3238  hypothetical protein  24.82 
 
 		 947 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0772641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2276  hypothetical protein  22.39 
 
 		 521 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656399  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  20.94 
 
 		 616 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  26.63 
 
 		 718 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  21.66 
 
 		 469 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  22.48 
 
 		 621 aa  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  21.07 
 
 		 470 aa  47.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  24.72 
 
 		 782 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  19.32 
 
 		 534 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  21.47 
 
 		 1287 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  20.56 
 
 		 515 aa  43.9  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>