37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3521 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3521  TPR domain protein  100 
 
 		 245 aa  484  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1228  hypothetical protein  37.16 
 
 		 204 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1258  hypothetical protein  36.7 
 
 		 204 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000323841 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2166  hypothetical protein  37.93 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2811  tetratricopeptide repeat-containing protein  35.29 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0556541  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0666  TPR repeat-containing protein  36.5 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.107374  normal  0.0631773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0350  hypothetical protein  36.84 
 
 		 132 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0301232  normal  0.125354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0878  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.79 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.213788  hitchhiker  0.0000283657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1164  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.660548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1134  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4498  Tetratricopeptide domain protein  31.5 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.45 
 
 		 557 aa  53.1  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2395  tetratricopeptide TPR_2  32.14 
 
 		 300 aa  52.4  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 377 aa  52.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1821  hypothetical protein  29.91 
 
 		 119 aa  52.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867185  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 602 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 586 aa  50.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2838  tetratricopeptide TPR_2  37.63 
 
 		 940 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 2262 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  20.85 
 
 		 767 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.08 
 
 		 2240 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  28.85 
 
 		 444 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  20.43 
 
 		 2262 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.86 
 
 		 571 aa  45.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 594 aa  45.4  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  24.66 
 
 		 475 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3840  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 350 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.745152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 615 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4615  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.14 
 
 		 1402 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0570  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 		 591 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.26 
 
 		 363 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.26 
 
 		 363 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  36.36 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4608  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 1404 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.406661 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  23.25 
 
 		 937 aa  42.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  25.43 
 
 		 695 aa  42.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1008  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 359 aa  42.4  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000389173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>