127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3316 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3316  membrane protein of unknown function  100 
 
 
134 aa  256  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1873  hypothetical protein  62.6 
 
 
129 aa  160  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  71.05 
 
 
136 aa  155  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0362  membrane protein of unknown function  66.67 
 
 
122 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  46.85 
 
 
117 aa  87  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  42.48 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  43.27 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  41.35 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  41.35 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  41.35 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  41.35 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  41.35 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  41.35 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  41.35 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  42.31 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  40.38 
 
 
117 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  40.38 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  42.31 
 
 
117 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  40.38 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  40.38 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  40.38 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  40.38 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  40.38 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  40.38 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  42.48 
 
 
115 aa  77  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  44.79 
 
 
117 aa  77  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  39.29 
 
 
115 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  46.15 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  42.06 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2165  membrane protein of unknown function  43.64 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.44463  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  42.34 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2118  membrane protein of unknown function  43.64 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  42.34 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  37.74 
 
 
117 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  41.12 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  33.64 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  37.27 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2518  hypothetical protein  43.27 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.505715 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  45.24 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  36.79 
 
 
118 aa  63.5  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  36.59 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  39.78 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  40.95 
 
 
134 aa  62.8  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  39.39 
 
 
117 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  43.04 
 
 
133 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  38.82 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  38.38 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  39.8 
 
 
111 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  41.46 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  36.89 
 
 
111 aa  60.1  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  34.38 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  34 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4032  membrane protein of unknown function  39.62 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  45.45 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  41.25 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3382  membrane protein of unknown function  39.62 
 
 
122 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  36.89 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  35.16 
 
 
112 aa  55.1  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  36.78 
 
 
113 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  36.94 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  35.23 
 
 
130 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  29.91 
 
 
111 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  35.8 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  31.76 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  28.95 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2032  membrane protein of unknown function  41.75 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000008644 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  37.68 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2284  membrane protein  27.19 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0520  membrane protein of unknown function  37.88 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4675  membrane protein of unknown function  35.65 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  36.45 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0137  membrane protein of unknown function  34.12 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2517  membrane protein of unknown function  32.58 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0110304 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1135  membrane protein of unknown function  42.19 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0708618 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  36.26 
 
 
130 aa  48.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  38.1 
 
 
115 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3225  membrane protein of unknown function  40.26 
 
 
137 aa  47  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  29.73 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  28.93 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0368  membrane protein of unknown function  32.05 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  26.8 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22880  predicted membrane protein  36 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1075  membrane protein of unknown function  31.4 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0562  hypothetical protein  30.21 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  34.21 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  38.64 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1090  membrane protein of unknown function  41.94 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  28.07 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.26379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4576  membrane protein of unknown function  31.53 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2616  hypothetical protein  31.13 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.506732  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25510  predicted membrane protein  35 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.355716  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0671  membrane protein of unknown function  39.45 
 
 
122 aa  43.5  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.17092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4413  membrane protein of unknown function  33.01 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0335  hypothetical protein  30.49 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00258054  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  29.59 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  27.55 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0255  hypothetical protein  40.26 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  32.94 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0493  membrane protein of unknown function  38.27 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050768 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>