192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4216 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4216  thioesterase domain protein  100 
 
 		 313 aa  645    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4499  thioesterase domain protein  97.44 
 
 		 313 aa  631  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4152  thioesterase domain protein  89.42 
 
 		 313 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4090  thioesterase domain-containing protein  82.32 
 
 		 329 aa  552  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4418  GNAT family acetyltransferase  82.32 
 
 		 329 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0993621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0032  acetyltransferase domain-containing protein  86.58 
 
 		 307 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0037  acetyltransferase domain-containing protein  86.58 
 
 		 307 aa  550  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4184  thioesterase domain-containing protein  86.58 
 
 		 307 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03773  putative acetyltransferase  83.6 
 
 		 329 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.871645  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4098  thioesterase domain protein  83.6 
 
 		 313 aa  541  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4273  acetyltransferase  83.6 
 
 		 313 aa  541  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4130  thioesterase domain-containing protein  83.6 
 
 		 313 aa  541  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.480913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5335  acetyltransferase, GNAT family  83.6 
 
 		 329 aa  542  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.251571 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03722  hypothetical protein  83.6 
 
 		 329 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.645417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4113  acetyltransferase  83.6 
 
 		 313 aa  541  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4411  thioesterase/acetyltransferase domain-containing protein  83.28 
 
 		 313 aa  541  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4366  acetyltransferase, GNAT family  83.28 
 
 		 313 aa  538  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4353  GNAT family acetyltransferase  82.64 
 
 		 313 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4262  acetyltransferase, gnat family  82.64 
 
 		 329 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4307  acetyltransferase, gnat family  82.64 
 
 		 329 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.913175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4240  acetyltransferase, gnat family  82.64 
 
 		 329 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3955  thioesterase domain protein  83.11 
 
 		 313 aa  533  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4876  thioesterase domain-containing protein  83.28 
 
 		 314 aa  533  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372984 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001898  galactoside O-acetyltransferase  51.01 
 
 		 305 aa  333  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00595  acetyltransferase  51.34 
 
 		 300 aa  332  4e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2936  putative acyltransferase  49.33 
 
 		 299 aa  329  5.0000000000000004e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2312  hypothetical protein  50 
 
 		 310 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3949  thioesterase domain-containing protein  41.06 
 
 		 308 aa  268  7e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03531  fused GNAT family acetyltransferase/PaaI-related uncharacterized conserved domain  42.47 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123025  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0902  acetyltransferase  39.73 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0315  thioesterase domain-containing protein  43.57 
 
 		 145 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00708885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0306  thioesterase domain-containing protein  42.86 
 
 		 157 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00971414  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0320  thioesterase domain-containing protein  42.14 
 
 		 145 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.127147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0319  thioesterase domain-containing protein  43.17 
 
 		 150 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00732818  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0323  thioesterase domain-containing protein  43.17 
 
 		 150 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.42127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0318  thioesterase domain-containing protein  43.17 
 
 		 150 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000336886  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4397  acetyltransferase  40.4 
 
 		 145 aa  119  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3905  thioesterase domain-containing protein  41.91 
 
 		 149 aa  119  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000215203  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0324  thioesterase domain protein  43.17 
 
 		 150 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3704  thioesterase domain-containing protein  42.86 
 
 		 145 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.120731  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0420  thioesterase domain-containing protein  44.6 
 
 		 149 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3401  acetyltransferase  45.71 
 
 		 147 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4614  thioesterase domain-containing protein  40.71 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0333  thioesterase domain-containing protein  39.29 
 
 		 164 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3541  thioesterase domain-containing protein  40 
 
 		 156 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3446  thioesterase, putative  35.33 
 
 		 192 aa  97.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000290362  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2158  thioesterase, putative  31.11 
 
 		 151 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1720  thioesterase domain protein  31.85 
 
 		 151 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0960141  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0274  thioesterase domain-containing protein  27.34 
 
 		 153 aa  68.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0287  thioesterase domain-containing protein  31.94 
 
 		 151 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1791  thioesterase domain protein  29.08 
 
 		 151 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4948  thioesterase domain-containing protein  29.58 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625869  hitchhiker  0.0000169868 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1330  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0879736  normal  0.150143 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  29.2 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4939  hypothetical protein  30.34 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1324  thioesterase domain-containing protein  28.57 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.317856  normal  0.994205 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2722  thioesterase domain protein  24.11 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0262  hypothetical protein  29.58 
 
 		 151 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0142583 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1843  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 		 159 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0277  thioesterase domain-containing protein  29.58 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2113  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 		 147 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3035  GCN5-related N-acetyltransferase  30.16 
 
 		 152 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0286  thioesterase, putative  28.17 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 		 159 aa  58.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.595635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5400  hypothetical protein  29.17 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2507  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 		 141 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0217  N-acetylglutamate synthase  39.08 
 
 		 196 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.145354 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03973  thioesterase domain, putative subfamily  26.4 
 
 		 180 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3245  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 		 142 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380354  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  32.99 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4334  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 		 143 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2490  acetyltransferase, GNAT family  27.74 
 
 		 144 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000166015  normal  0.210823 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0132  thioesterase domain protein  29.63 
 
 		 155 aa  52.8  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1708  acetyltransferase  30.83 
 
 		 150 aa  52.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5274  GCN5-related N-acetyltransferase  41.56 
 
 		 137 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1915  putative acetyltransferase  34.41 
 
 		 141 aa  52.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2799  acetyltransferase, GNAT family  25.34 
 
 		 144 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134155 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13050  N-acetylglutamate synthase  36.56 
 
 		 169 aa  52.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0334  N-acetylglutamate synthase  33.62 
 
 		 169 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3246  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 		 141 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2802  acetyltransferase, GNAT family  27.74 
 
 		 144 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.283335  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  32.99 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2879  N-acetylglutamate synthase  40.85 
 
 		 191 aa  50.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00976241  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1114  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 		 144 aa  50.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1947  GCN5-related N-acetyltransferase  36.54 
 
 		 159 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4357  GCN5-related N-acetyltransferase  36.46 
 
 		 143 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744506  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3419  GCN5-related N-acetyltransferase  32.23 
 
 		 189 aa  50.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2555  acetyltransferase  24.66 
 
 		 144 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0530574  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3286  acetyltransferase  32.18 
 
 		 149 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.867207 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4202  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 		 143 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2061  acetyltransferase  32.5 
 
 		 149 aa  49.7  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450214  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1774  hypothetical protein  30.08 
 
 		 148 aa  49.7  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2358  GCN5-related N-acetyltransferase  36.9 
 
 		 180 aa  49.7  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2946  acetyltransferase  30.65 
 
 		 150 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1624  acetyltransferase  29.92 
 
 		 161 aa  49.7  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 		 162 aa  49.7  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2597  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 		 144 aa  49.3  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00223569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1830  phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribotide isomerase  36.36 
 
 		 389 aa  49.3  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  30.16 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>