More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2616 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2616  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  621  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1850  protein of unknown function DUF6 transmembrane  90.88 
 
 		 308 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152184  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0375  hypothetical protein  69.21 
 
 		 312 aa  421  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00512602  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1657  hypothetical protein  71.48 
 
 		 308 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1548  integral membrane protein  71.48 
 
 		 308 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4813  exported membrane protein  67.97 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000948191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4673  exported membrane protein  67.97 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000162371  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4755  exported membrane protein  67.65 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000669886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4791  hypothetical protein  67.97 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00231071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4663  exported membrane protein  67.97 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00303431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3828  hypothetical protein  62.54 
 
 		 311 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1714  hypothetical protein  71.03 
 
 		 238 aa  306  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.100165  hitchhiker  0.0002003 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12940  membrane protein  41.37 
 
 		 311 aa  225  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000993304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0526  transporter, EamA family  40.65 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  41.12 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0389  DMT family permease  40.38 
 
 		 316 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0456  transporter, EamA family  40.38 
 
 		 316 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0398  EamA family protein  40.38 
 
 		 316 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0411  eama family protein  40.38 
 
 		 316 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0525  EamA family protein  40 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0386  DMT family permease  40.06 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00214072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0476  transporter, EamA family  40 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4847  transporter, EamA family  39.68 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0398  hypothetical protein  38.94 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0050  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.51 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.71429  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3635  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1245  putative permease  29.6 
 
 		 310 aa  95.9  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499311  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  28.87 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.1 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  27.09 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  27.84 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.92 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.1 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  24.25 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  24.13 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  25.17 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  24.44 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  24.13 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  26.76 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  24.83 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  24.63 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  27.97 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  26.53 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.67 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  24.04 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  23.1 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  24.05 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  26.89 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.38 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.48 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  26.8 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  23.1 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  26.49 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  24.02 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  27.84 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  26.21 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.95 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  26.94 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  27.95 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  24.58 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0315  hypothetical protein  26.21 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  26.64 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.15 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  26.57 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  26.87 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  26.76 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  26.03 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0432  hypothetical protein  27.07 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  26.82 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  27.3 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  23.29 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1085  DMT superfamliy efflux pump  25.8 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  25.91 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.03 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  25.44 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  26.32 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  26.36 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.01 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  23.08 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.24 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  23.26 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  25.82 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  28.62 
 
 		 302 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.11 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  25.94 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  25 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  26.69 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  27.67 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>