128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0050 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0050  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
302 aa  584  1e-166  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.71429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  32.8 
 
 
330 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0526  transporter, EamA family  33 
 
 
330 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0398  EamA family protein  32.48 
 
 
316 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0389  DMT family permease  32.48 
 
 
316 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0386  DMT family permease  32.79 
 
 
316 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00214072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0411  eama family protein  32.48 
 
 
316 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0398  hypothetical protein  33.44 
 
 
316 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0456  transporter, EamA family  32.48 
 
 
316 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4847  transporter, EamA family  32.48 
 
 
316 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0476  transporter, EamA family  32.48 
 
 
316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0525  EamA family protein  32.15 
 
 
316 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12940  membrane protein  33.22 
 
 
311 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000993304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2616  hypothetical protein  30.51 
 
 
310 aa  142  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0375  hypothetical protein  29.1 
 
 
312 aa  142  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00512602  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1548  integral membrane protein  31.31 
 
 
308 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1657  hypothetical protein  31.31 
 
 
308 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1850  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.83 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152184  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3828  hypothetical protein  31.62 
 
 
311 aa  136  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4813  exported membrane protein  30.54 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000948191  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4663  exported membrane protein  30.54 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00303431  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4673  exported membrane protein  30.54 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000162371  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4791  hypothetical protein  30.54 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00231071  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4755  exported membrane protein  30.54 
 
 
308 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000669886  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1714  hypothetical protein  32.21 
 
 
238 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.100165  hitchhiker  0.0002003 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3635  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 
306 aa  102  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  29.18 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.94 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  28.47 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.33 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1245  putative permease  25.51 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  26.95 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  30.18 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  27.3 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  28.62 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.18 
 
 
301 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  27.18 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  27.18 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  27.18 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0267  hypothetical protein  29.23 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  27.18 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  26.86 
 
 
301 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  27.18 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.86 
 
 
301 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.11 
 
 
367 aa  59.7  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.59 
 
 
340 aa  59.3  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  25.32 
 
 
293 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.47 
 
 
288 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.89 
 
 
317 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  26.2 
 
 
316 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.97 
 
 
294 aa  55.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.88 
 
 
348 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  25.83 
 
 
316 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  26.89 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  26.47 
 
 
283 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  27.33 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  22.85 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 
293 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  25.28 
 
 
298 aa  53.9  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.09 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  22.12 
 
 
301 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  23.22 
 
 
293 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  22.76 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  22.76 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  22.76 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  22.76 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  22.76 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  22.76 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  22.12 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  24.37 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.05 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  24.32 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  26.05 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.45 
 
 
317 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  23.05 
 
 
298 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.79 
 
 
290 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  21.71 
 
 
343 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  26.05 
 
 
326 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  26.76 
 
 
312 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.1 
 
 
313 aa  49.7  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  24.06 
 
 
329 aa  49.7  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  22.01 
 
 
293 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  21.54 
 
 
293 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.75 
 
 
309 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255385 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  21.54 
 
 
321 aa  49.3  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  25.52 
 
 
294 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  22.37 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  24.57 
 
 
314 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  21.54 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  21.54 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.83 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  22.78 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  22.61 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  20.07 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  21.58 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  26.94 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.14 
 
 
314 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.08 
 
 
310 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3272  hypothetical protein  25.54 
 
 
314 aa  47  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  23.33 
 
 
287 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>