209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2457 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2457  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  589  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2759  hypothetical protein  98.17 
 
 		 273 aa  555  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1656  hypothetical protein  88.64 
 
 		 273 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1688  hypothetical protein  87.91 
 
 		 273 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2173  hypothetical protein  84.98 
 
 		 292 aa  490  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0501659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1736  hypothetical protein  83.52 
 
 		 273 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1842  hypothetical protein  83.52 
 
 		 273 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01672  hypothetical protein  80.95 
 
 		 277 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1939  protein of unknown function DUF299  80.95 
 
 		 277 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2421  hypothetical protein  80.95 
 
 		 277 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1907  hypothetical protein  80.59 
 
 		 277 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1928  hypothetical protein  80.95 
 
 		 277 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.868856  normal  0.230597 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1487  hypothetical protein  80.95 
 
 		 277 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.88593 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1921  hypothetical protein  80.95 
 
 		 277 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01661  hypothetical protein  80.95 
 
 		 277 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.311887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1783  hypothetical protein  80.95 
 
 		 277 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1997  hypothetical protein  80.95 
 
 		 277 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.140597 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1477  hypothetical protein  80.95 
 
 		 277 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.913842  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1825  hypothetical protein  80.95 
 
 		 277 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1744  hypothetical protein  80.95 
 
 		 277 aa  465  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59069  normal  0.0126649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1459  hypothetical protein  80.95 
 
 		 277 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1443  hypothetical protein  80.95 
 
 		 277 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.222292  normal  0.0952573 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2073  hypothetical protein  60.15 
 
 		 270 aa  346  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2550  hypothetical protein  59.41 
 
 		 270 aa  337  9e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00201421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1870  hypothetical protein  59.78 
 
 		 270 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142601  hitchhiker  0.00000127177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2716  hypothetical protein  58.67 
 
 		 270 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00410652  hitchhiker  0.000599998 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1548  hypothetical protein  58.67 
 
 		 270 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000386745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1591  hypothetical protein  58.89 
 
 		 270 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00125366  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1666  hypothetical protein  58.89 
 
 		 270 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00389139  unclonable  0.0000164023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1735  hypothetical protein  58.89 
 
 		 270 aa  334  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0066836  normal  0.176615 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2645  hypothetical protein  58.89 
 
 		 270 aa  333  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2482  hypothetical protein  58.52 
 
 		 270 aa  331  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1862  hypothetical protein  58.52 
 
 		 270 aa  331  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0232488  hitchhiker  0.0000000237766 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2602  hypothetical protein  58.52 
 
 		 270 aa  331  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00819794  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2489  hypothetical protein  58.52 
 
 		 270 aa  331  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.230997  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2010  hypothetical protein  57.25 
 
 		 270 aa  331  8e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2244  hypothetical protein  58.52 
 
 		 270 aa  331  8e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.277216  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2298  hypothetical protein  57.04 
 
 		 270 aa  331  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000577143  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02383  hypothetical protein  56.62 
 
 		 270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1743  hypothetical protein  54.78 
 
 		 270 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000647  hypothetical protein  52.77 
 
 		 278 aa  301  6.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06516  hypothetical protein  51.66 
 
 		 278 aa  295  8e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0252  hypothetical protein  51.66 
 
 		 277 aa  288  5.0000000000000004e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1498  hypothetical protein  47.62 
 
 		 271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1485  hypothetical protein  47.25 
 
 		 271 aa  280  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3013  hypothetical protein  50.55 
 
 		 269 aa  280  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.369188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41680  hypothetical protein  48.35 
 
 		 274 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1769  hypothetical protein  50.18 
 
 		 272 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3538  hypothetical protein  48.35 
 
 		 272 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2089  hypothetical protein  49.08 
 
 		 272 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1592  hypothetical protein  48.36 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252196  normal  0.045095 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2291  hypothetical protein  49.08 
 
 		 272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.909521  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3659  hypothetical protein  48.73 
 
 		 272 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0717061  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2081  hypothetical protein  48.36 
 
 		 272 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0669106 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23260  hypothetical protein  46.52 
 
 		 272 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183047  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1599  hypothetical protein  47.64 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.852515  hitchhiker  0.0000000322533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2084  hypothetical protein  47.25 
 
 		 272 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00711246  normal  0.0225535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1884  hypothetical protein  46.86 
 
 		 271 aa  268  8e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1889  hypothetical protein  47.23 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.685716  normal  0.213154 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2063  hypothetical protein  48.19 
 
 		 277 aa  260  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.557113  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1758  hypothetical protein  46.1 
 
 		 272 aa  257  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.572502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1406  hypothetical protein  49.25 
 
 		 267 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.968755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1815  hypothetical protein  48.16 
 
 		 273 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1361  hypothetical protein  44.28 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1905  hypothetical protein  46.3 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.617722 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2036  hypothetical protein  46.3 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.613437  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1297  hypothetical protein  42.81 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0133713  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6074  hypothetical protein  45.93 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.214227  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2023  hypothetical protein  45.93 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0775457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2003  hypothetical protein  45.93 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1273  hypothetical protein  45.93 
 
 		 271 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1322  hypothetical protein  45.19 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1420  hypothetical protein  43.54 
 
 		 279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.0263307 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0950  hypothetical protein  45.45 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034537  hitchhiker  0.00814679 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5313  hypothetical protein  45.56 
 
 		 271 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0599307  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1698  hypothetical protein  45.56 
 
 		 287 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1452  hypothetical protein  43.91 
 
 		 270 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000190114  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2439  hypothetical protein  45.56 
 
 		 271 aa  242  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.0202709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2190  hypothetical protein  46.52 
 
 		 273 aa  242  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1539  hypothetical protein  44.81 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000339618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2566  hypothetical protein  44.81 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1128  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2039  hypothetical protein  44.81 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000106552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3272  hypothetical protein  44.81 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000389309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2420  hypothetical protein  44.81 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000632671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2476  hypothetical protein  44.81 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00018837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1311  hypothetical protein  44.81 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000394602  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1865  hypothetical protein  43.54 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0336096  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2043  hypothetical protein  44.44 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.00000000000286207  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0219  hypothetical protein  47.6 
 
 		 273 aa  240  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00923  hypothetical protein  44.44 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.052197  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2049  hypothetical protein  46.69 
 
 		 273 aa  238  6.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1334  hypothetical protein  44.65 
 
 		 298 aa  237  1e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1035  hypothetical protein  44.65 
 
 		 298 aa  237  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0046897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1520  hypothetical protein  45.39 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2367  hypothetical protein  45.22 
 
 		 276 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2834  hypothetical protein  45.22 
 
 		 273 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2880  hypothetical protein  45.22 
 
 		 276 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0279638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0549  hypothetical protein  44.12 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.10493  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3043  hypothetical protein  45.42 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2656  hypothetical protein  46.62 
 
 		 314 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000624696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>