46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2341 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2341  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  297  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.438637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  31.3 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  29.91 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  34.12 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  36.11 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  31.4 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  36.11 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  36.11 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  36.11 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  36.11 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  27.97 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  36.11 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  29.06 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  32.17 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  34.72 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  38.16 
 
 		 138 aa  52  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0855  hypothetical protein  35.4 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  26.72 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  27.12 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  23.28 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  24.14 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3436  hypothetical protein  27.07 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.64721  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  27.73 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1511  hypothetical protein  26.72 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5025  hypothetical protein  25.56 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  29.91 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  25.64 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4174  hypothetical protein  37.31 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  26 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  25.64 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  26.19 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1727  hypothetical protein  23.85 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0495  hypothetical protein  27.48 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.336133 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6756  hypothetical protein  43.59 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  25.4 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  25.44 
 
 		 150 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  28.07 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  25 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  28.95 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  28.95 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  31.94 
 
 		 161 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2801  hypothetical protein  43.14 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  28.17 
 
 		 158 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  23.39 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  36.71 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>