27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0469 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0469  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 502 aa  1018    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0483  outer membrane efflux protein  84.26 
 
 		 502 aa  855    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0393  outer membrane efflux protein  83.67 
 
 		 502 aa  846    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0161  Outer membrane efflux protein  63.98 
 
 		 504 aa  650    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0676  outer membrane efflux protein  66 
 
 		 516 aa  669    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773648  hitchhiker  0.0000779831 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0564  outer membrane efflux protein  96.41 
 
 		 502 aa  987    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0420  outer membrane efflux protein  39.57 
 
 		 552 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3184  outer membrane efflux protein  40.44 
 
 		 515 aa  361  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.911982 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5408  putative efflux outer membrane protein  39.2 
 
 		 506 aa  362  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0297  outer membrane efflux protein  38.85 
 
 		 537 aa  352  8e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2053  hypothetical protein  37.76 
 
 		 605 aa  349  8e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0678  hypothetical protein  37.68 
 
 		 595 aa  348  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0906  hypothetical protein  37.68 
 
 		 600 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1670  outer membrane efflux protein  38.82 
 
 		 526 aa  347  4e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000434789  normal  0.249137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3076  outer membrane efflux protein  35.33 
 
 		 502 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0368  Outer membrane protein-like  38.18 
 
 		 609 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3737  outer membrane efflux protein  35.31 
 
 		 496 aa  277  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1150  outer membrane efflux protein  34.12 
 
 		 746 aa  270  5.9999999999999995e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 		 476 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 		 476 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  29.87 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  24.66 
 
 		 491 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  29.44 
 
 		 454 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2941  outer membrane efflux protein  21.03 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0140963  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21.82 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4942  outer membrane efflux protein  27.07 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755187  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 635 aa  45.8  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>