36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_28661 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_28661  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0408  von Willebrand factor type A  55.77 
 
 
236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1319  hypothetical protein  31.84 
 
 
229 aa  119  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.643261 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04030  hypothetical protein  33.54 
 
 
268 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04060  hypothetical protein  33.33 
 
 
272 aa  98.6  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.151575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  28 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  34.81 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  24.08 
 
 
219 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  24.52 
 
 
212 aa  55.5  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  29.19 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  23.08 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  29.45 
 
 
350 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  28.57 
 
 
346 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  26.99 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  26.99 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  28.57 
 
 
346 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
346 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  26.99 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  23.56 
 
 
212 aa  48.9  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.13 
 
 
674 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
346 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1629  hypothetical protein  30.09 
 
 
469 aa  45.8  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  30.77 
 
 
699 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  25.86 
 
 
629 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.8 
 
 
616 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  37.08 
 
 
222 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  25.74 
 
 
225 aa  45.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3096  von Willebrand factor type A  29.2 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0378393  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  21.99 
 
 
380 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  24.69 
 
 
352 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  28.24 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  26.67 
 
 
383 aa  42.4  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  25.62 
 
 
776 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  27.83 
 
 
614 aa  42  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  30.16 
 
 
637 aa  42  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.41 
 
 
653 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>